ANTİXƏRÇƏNG XASSƏLI TRİPEPTİD MOLEKULUNUN FƏZA QURULUŞU
Təranə BİNNƏTOVA, Gülyaz NƏCƏFOVA,
Gülşən
AĞAYEVA
Qafqaz Universiteti, Bakı Dövlət Universiteti
binnatova@inbox.ru
AZƏRBAYCAN
Təqdim olunan işdə H-Tyr-Ser-Leu-OH tripeptid molekulu nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə tədqiq olunmuşdur.
Bioloji tədqiqatlardan məlumdur ki, Tyr-Ser-Leu tripeptid molekulu qaraciyərdə BEL-7402 xərçəng hüceyrələrinin
inkişafını dayandırır [1-4]. Bu keyfiyyətinə görə tripeptidin farmakoloji xüsusiyyətləri terapevtik marag kəsb edir və onun
xərçəng xəstəliyinin müalicəsində istifadəsi nəzərdə tutulur. Son illər dərman əhəmiyyətli peptidlərə elmi maraq artmışdır.
Məlumdur ki, kiçik peptid molekulları sərbəst halda fizioloji mühitdə özlərinəməxsus stabil konformasiya vəziyyətlərində
bioloji təsir göstərə bilirlər. Peptidlərin təsir mexanizmlərini öyrənmək üçün ilk növbədə onların konformasiya
vəziyyətlərini müəyyən etmək vacibdır. Bu baxımdan molekulun konformasiya imkanlarının öyrənilməsi onun təsir
mexanizminin aşkarlanmasına və yeni daha təsirli analoqların yaranmasına səbəb ola bilər.
Nəzəri konformasiya analizi üsulunda atomlar arasındakı qarşılıqlı təsirin ümumi enerjisi Van-der-Vaals,
elektrostatik, torsion qarşılıqlı təsir enerjiləri və hidrogen rabitəsi enerjisinin cəmi kimi hesablanır [5]. Bucaqların
hesablanması İUPAC-İUB nomenklaturasına əsasən aparılıb [6]. Quruluş məsələlərin həlli zamanı N.M.Qocayev və
İ.S.Maksumov tərəfindən tərtib edilmiş universal proqram və alqoritm bütün tələbləri tamamilə nəzərə alır və müxtəlif
peptidlərin fəza quruluşlarının tədqiqində istifadə edilir [7]. Enerjinin minimumlaşması birinci tərtib törəmələrə görə
qradient üsulu ilə aparılır. Molekulun əsas zəncirin müxtəlif formaları iki sinfə ayrılır: bükülü (f) və açıq (e) şeyplər.
Tripeptid üçün yalnız dörd şeyp yaranır. Hesablamada tədqiq olunan tripeptidin atom modeli 54 atomdan ibarətdir və bu
modeldə 18 ikiüzlü bucağı nəzərə alınmişdır. Peptidin əsas zəncirində birqat C
α
-N,C
α
-C
'
,N-C
'
rabitələri və yan zəncirlərin
bucaqları ətrafinda fırlanma nəticəsində həndəsi paremetrlər, qarşılıqlı təsirin enerji payları, qalıqlararası qarşılıqlı təsirin
enerji payları, optimal konformasiya vəziyyətlərin ikiüzlü bucaqların qiymətləri və ümumi enerji təyin edilmişdir.
Qafqaz Uni
Dostları ilə paylaş: |