Maxsus tizimga kiruvchi davlat organlari ekologiya sohasidagi tegishli vakolatlariga qarab kompleks, tarmoqlararo va funksional guruhlariga bo‘linadi.
Kompleksguruhlariga kiruvchi davlat organlariga quyidagilardir.
Tabiatni muhofaza qilish davlat qo‘mitasi;
v) Geologiya va mineral resurslar davlat qo‘mitasi;
g) Ichki ishlar vazirligi;
d) O‘zgeodezkadastr davlat qo‘mitasi;
Funksionalguruhga quyidagilar kiradi:
Ichki ishlar vazirligi;
Bojxona qo‘mitasi;
v) Davlat solih qo‘mitasi;
Sanoatda, konchilikda va maishiy sektorda ishlarni bexatar olib borishni nazorat qilish davlat inspeksiyasi;
j) Davlat arxitektura qurilish qo‘mitasi va boshqalar.
YUqorida nomlari ko‘rsatib o‘tilgan barcha vazirlik va qo‘mitalar ekologiya sohasida boshqaruv va nazorat etish ishlarini amalga oshirish jaryonida O‘zbekiston Respublikasi qonunlariga Prezident farmonlari va Vazirlar Mahkamasining barcha qarorlari hamda Oliy Majlis Qonunchilik palatasi va Senati tomonidan qabul qilingan qonun va qarorlarni bajaradilar, shuningdek o‘z nizomlari va boshqa normativ hujjatlarga tayanib ish olib boradilar.