II INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
40
Qafqaz University
18-19 April 2014, Baku, Azerbaijan
fraqmentinin hesablamaları göstərmişdir ki, eee açılmış şəkildə olan şeypin BBBB formalarında həm histeinin və həm də
tirozinin yan zəncirinin ikiüzlü
1
bucağının
0
180
olması energetik cəhətdən daha əlverişli olmuşdur.
Tədqiqat işində istifadə olunan parametrlər, atom-atom potensialları ilə təsvir olunan müxtəlif növ qarşılıqlı təsirlər-
elektrostatik, qeyri-valent qarşılıqlı təsirlər və torsion potensial bütün əlverişli konformasiyalar üçün hesablanmışdır.
Tetrapeptid fraqmentin potensial enerjisi bir neçə toplananın cəmindən ibarətdir:
tors
h
el
v
q
E
E
E
E
E
Burada
v
q
E
- qeyri-valent rabitəsində olan atomların qarşılıqlı enerjisi,
el
E
- elektrostatik qarşılıqlı enerjisi,
h
E
-
hidrogen
rabitəsinin enerjisi,
tors
E
- torsion enerjidir.
Verilmiş işdə atom-atom potensialları - Lennard-Consun “6-12” və Bukingemin “6-exp” potensiallarından istifadə
edilmişdir:
12
6
Br
Ar
E
v
q
)
exp(
6
Cr
B
Ar
E
v
q
T7 peptidinin His1-Ala2-İle3-Tyr4 tetrapeptid fraqmentinin nəzəri konformasiya analizi metodu ilə öyrənilməsi
molekula daxil olan digər amin turşu qalıqlarının və eləcə də bütövlükdə molekulun özünün tədqiq olunması üçün əlverişli
hesab edilir.
Dostları ilə paylaş: