Yaponiya oliy ta’lim tizimi Yaponiyada ta'lim sifati yuqori va butun dunyoda tan olingan. QS xalqaro reytingi Yaponiyaning beshta universitetini dunyodagi eng yaxshi 100 ta universitetlar ro‘yxatiga kiritdi.
Bakalavr dasturlari odatda 4 yil davom etadi. Tibbiyot sohalarida (tibbiy biznes, stomatologiya, veterinariya) ixtisoslashgan talabalar 6 yil o‘qiydilar. O‘quv yili aprel oyida boshlanadi va keyingi yilning mart oyida tugaydi. O‘quv rejasi nazariy tadqiqotlar, ma'ruzalar, seminarlar, laboratoriya ishlari, mahorat darslari, amaliyot va tadqiqotdan iborat. O‘qish oxirida talabalar odatda ilmiy dissertatsiya yozadilar va himoya qiladilar. Bakalavriat bitiruvchilari ish qidirish yoki magistraturaga hujjat topshirish huquqiga ega.
Magistratura va doktorantura — Yaponiyada aspirantura Magistratura va doktorantura dasturlari mustaqil ta’lim muassasalari yoki universitetlarning bir qismi bo‘lishi mumkin bo‘lgan aspiranturalar tomonidan tashkil etiladi. Magistratura kursiga kirish uchun talabalar quyidagi shartlardan birini bajarishlari kerak: Yaponiya universitetida bakalavriat ta'limini tamomlagan; Boshqa davlatda 16 yillik o‘qishni (shu jumladan o‘rta maktabni) tugatgan; 22 yoshda bo‘ling, bakalavr darajasiga (yoki unga tenglashtirilgan) yoki undan yuqori darajaga ega bo‘ling. Ko‘pgina yapon universitetlari, Yevropa universitetlaridan farqli o‘laroq, ular aspiranturaga kirishda kirish imtihonlarini tashkil qiladilar . Mavzular uch toifaga bo‘linadi: asosiy, tadqiqot va tanlov. Dastlabki uch semestr nazariyani oʻrganishga, oxirgi semestr esa ilmiy ish (tezis) yozishga bagʻishlangan. Trening yakunida talabalar yakuniy imtihonlarni topshiradilar va o‘z ishlarini himoya qiladilar.
Doktorantura - Yaponiyada aspirantura Doktorantura o‘rtacha 3 yil davom etadi. Qabul qilish uchun talabalar magistr darajasiga ega bo‘lishlari va kirish testlarini topshirishlari kerak. Bundan tashqari, talabalar, odatda, maqsad va vazifalarni, ishning dolzarbligini, shuningdek, rejalashtirilgan tadqiqotning batafsil rejasini tushuntirib, xat yuborish orqali kelajakdagi rahbar bilan oldindan bog‘lanishlari kerak.