79
maydonida ionlantirish (maydon desorbtsiyasi) va tezlashtirilgan
atomlar bilan (katta kinetik energiyaga ega Ar yoki Xe atomlari)
ionlantirish kabi yangi usullar tatbiq qilingan. So’nggi ikki usulni
qo’llaganda tekshirilayotgan moddani dastlabki bug’latish usuliga
xojat qolmaydi, chunki bu ionlantirish bilan bir vaqtda sodir bo’ladi.
Ko’pchilik holatlarda ionlantirish jarayonlarida bug’langan modda
molekulalaridan elektronlarni “urib chiqarish” sodir bo’lib,
bunda
musbat
zaryadlangan
zarrachalar
hosil
bo’ladi.
Peptidlar
molekulalarida peptid bog’idagi karbonil guruhining kislorod
atomlari va shu bog’dagi azot atomlari eng oson ionlanadilar. Hosil
bo’layotgan ionlarni parchalanishida musbat zaryadga
-holatda
joylashgan bog’lar parchalanadi. Bunday parchalanish natijasida
peptid hosilalarining molekulyar ionlaridan aminokislota
va
aldimin
fragmentlari hosil bo’ladi.
Tekshirilayotgan peptidni molekulalarini
birlamchi ionlanishida
musbat zaryad turli kislorod va azot atomlarida lokallangani uchun,
keyingi parchalanishda imkon bori
va
fragmentlanishni
mahsulotlari hosil bo’ladi. Aminokislota va aldimin fragmentlarini
mass-spektrda aniqlash peptidni tuzilishi haqida asosiy ma’lum otni
beradi. Peptidlarni molekulyar ionlarini aminokislota turidagi
fragmentlanishi yagona emasdir, balki aminokislotani
yon zanjirlari
mass-spektrni umumiy ko’rinishiga o’z hissasini qo’shadi. Yon
zanjirni o’ziga xos parchalanishida hosil bo’ladigan fragment ionlar
peptidlar tuzilishi haqida qo’shimcha ma’lumot beradi. Mass-
spektrometrik usulni yutuqlaridan biri erkin
-aminoguruhga ega
80
emas peptidlarni tekshirish mumkinligidir. Elektron ionlanish orqali
nisbatan qisqa peptidlarni (4-6 qoldiq) tekshirish mumkin.
Tezlashtirilgan atomlar bilan bombardimon qilish usuli orqali
molekulyar massasi 3000 gacha bo’lgan peptidlarni mass-
spektrini olish mumkinligini ko’rsatdi. Tekshirish uchun 1-5 nmol
modda kerak xolos, ya’ni sezgirligi bo’yicha mass-spektrometrik usul
boshqa usullardan qolishmaydi. Tezlashtirilgan
atomlar bilan
bombardimon qilish hamda maydon desorbtsiyasi usullarini ustun
tomoni shundaki, peptidni uchuvchan bo’lishi uchun modifitsirlash
lozim
emas.
Hozirgi
vaqtda
tezlashtirilgan
atomlar
bilan
bombardimon qilib ionlantiruvchi mass-spektrometriya o’rtacha
molekulyar massaga ega peptidlarni (15-40 aminokislota ketma-
ketligi) tuzilishini aniqlashda eng rivojlangan usullardan biri
hisoblanadi. Maydon desorbsiyasi orqali
ionlantirilganda peptidlar
mass-spektri faqat molekulyar ionlardan iborat bo’ladi. Bu usulni
Edman degradasiyasi bilan qo’shib
Ya.Shimonishi
oqsil va peptidlar
tuzilishini o’rganishni yangi usulini ishlab chiqqan. Bunda peptidlar
aralashmasi Edman bo’yicha degradatsiya qilinib, har bir bosqichdan
keyin ajralgan aminokislotalarni aniqlash bilan birga molekulyar
ionlar bo’yicha peptidlarning molekulyar massasi mass-spektrometrik
aniqlanadi. Mutant oqsillarni o’rganishda bu usul yuqori samaradorlik
beradi.
Dostları ilə paylaş: