Qulf va kalit modeli: Ferment-substrat o'zaro ta'sirining qulf va kalit modeli substrat va faol maydon o'rtasidagi aniq moslikni tavsiflaydi, xuddi qulfga o'rnatilgan kalit kabi. Ushbu model faol saytning o'ziga xos shakli muhimligini ta'kidlaydi.
Induced Fit: Induktsiyalangan moslik modelida faol joy substrat bog'langanda konformatsion o'zgarishlarga duch kelishi mumkin. Substratning bog'lanishi fermentdagi strukturaviy o'zgarishlarni keltirib chiqaradi, bu ikkalasi o'rtasidagi o'zaro ta'sirni optimallashtiradi.
Kofaktorlar: Ba'zi fermentlar samarali ishlashi uchun kofaktorlarni talab qiladi. Kofaktorlar noorganik ionlar (masalan, Mg²⁺ kabi metall ionlari) yoki organik molekulalar bo'lishi mumkin. Kofaktorlar ko'pincha substratni bog'lash yoki katalitik reaktsiyalarda yordam beradi.
Koenzimlar: Koenzimlar kofaktor vazifasini bajaradigan organik molekulalardir. Ular kimyoviy guruhlarni berish yoki qabul qilish orqali katalitik reaktsiyalarda bevosita ishtirok etadilar. Umumiy koenzimlarga NAD⁺, NADP⁺, FAD va koenzim A kiradi.
To'rtlamchi tuzilish: Ba'zi fermentlar to'rtlamchi tuzilishni hosil qilish uchun birlashadigan bir nechta oqsil bo'linmalaridan iborat. Ushbu bo'linmalar faol ferment kompleksini yaratish uchun hamkorlikda ishlaydi.
pH sezgirligi: Ferment faolligiga atrof-muhitning pH darajasi ta'sir qiladi. Ko'pgina fermentlar optimal pH diapazoniga ega bo'lib, ular eng samarali ishlaydi. Ushbu pH diapazonidan chetga chiqish ferment faolligini pasayishiga olib kelishi mumkin.
Harorat sezgirligi: Fermentlar optimal faoliyat uchun maxsus harorat diapazonlariga ham ega. Ushbu diapazondan tashqaridagi haroratlar denaturatsiyaga olib kelishi mumkin, bu erda ferment o'zining strukturaviy yaxlitligi va faolligini yo'qotadi.
Allosterik joylar: Ba'zi fermentlar faol joydan ajralib turadigan allosterik joylarga ega. Allosterik joylarga bog'langan molekulalar ferment faolligini modulyatsiya qilishi mumkin, uni kuchaytiradi yoki inhibe qiladi.