Microsoft Word 00 KeyNote Speakers Materiallar
IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
Yüklə 22,28 Mb. Pdf görüntüsü
|
- Bu səhifədəki naviqasiya:
- IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
- PHE-PHE DİPEPTİD MOLEKULUNUN KONFORMASİYA DİNAMİKASI Ə.S.İLYASOVA
- EFFECT ON STRUCTURAL PROPERTIES BY REPLACEMENT OF Ca→Ba IONS IN Ca x Ba 1-x Ga
- ÜÇÜNCÜ TƏRTİB DİSKRET MULTİPLİKATİV TÖRƏMƏLİ TƏNLİK ÜÇÜN KOŞİ MƏSƏLƏSİNİN HƏLLİ
|
IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 118
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan
U exp
0 , buradan τ 0 =10
-12 san alınır. Bu müddət bərk cisimlərdə atomların məxsusi rəqs periodlarının üzərinə düşür,U – mexaniki dağılma prosesinin aktivləşmə enerjisi olub materiala təsir edən mexaniki gərginlikdən asılıdır. Yuxarıdakı ifadədən istifadə etməklə onu aşağıdakı kimi hesablamaq olar. U=2,3RT(lgτ-lgτ 0 ) burada τ və τ 0 müvafiq olaraq T temperaturunda və T=0 temperaturda uzunömürlülük müddətləridir.
Qafqaz Universiteti serxan.bagirli@gmail.com AZƏRBAYCAN Təqdim olunan işdə məqsəd: Leu-Leu dipeptidin konformasiya xüsusiyyətlərinin araşdırıb enerji paylarını müəyyənləşdirməkdir. Nəzəri konformasiya analizi üsuluna əsaslanaraq dipeptidin mümkün olan konformasiyaları kompyüterdə modelləşdirmə yolu ilə müəyyənləşdirilmiş və Leu-Leu (Leysin- Leysin) dipeptid molekulunun fəza quruluşu bu üsulun qəbul etdiyi nəzəriyyələrə əsasən polyar mühit üçün (dielektrik sabiti ε=10) tədqiq olunmuşdur. Nəzəri konformasiya analizi üsulunda peptid molekunun tam potensial enerjisinin qiyməti Van-der-Vaals , elektrostatik, torsion qarşılıqlı təsirlərinin və hidrogen rabitələrinin enerji paylarının cəmi kimi nəzərə alınmışdır. Konformasiya məsələlərinin həlli zamanı N.M.Qocayev və İ.S.Maksumov tərəfindən tərtib edilmiş universal proqram alqoritmindən istifadə edilmişdir. Enerjinin minimumlaşması birinci tərtib törəmələrə görə qradient üsulu ilə hesablanır. İkiüzlü bucaqların hesablanması İUPAC-İUB nomenklaturasına əsasən aparılmışdır. Leu-Leu dipeptidi 49 atomdan ibarətdir, hesablamalar ikiüzlü bucaqların mümkün qiymətlərində aparılmışdır. Alınan nəticələr cədvəl 1-də verilmişdir.
Əsas zəncirin formaları Qeyri valent q/t enerjisi Elektrostatik q/t enerjisi Tarsion q/t enerjisi Ümumi
enerji Nisbi
enerji Şeyp
R 21 R 21
-7.46 0.47 0.92 -6.07 0 f L 21 B 33 -7.63 0.92 1.30 -5.40 0.67 e
22 R 31 -7.15 0.49 2.00 -4.65 1.42 f
22 R 32 -7.54 0.88 2.03 -4.63 1.44 e
23 R 21 -6.87 0.47 1.82 -4.58 1.49 f
22 R 22 -6.26 0.57 1.15 -4.54 1.53 e
22 R 32 -7.46 0.94 2.06 -4.47 1.6 e
23 R 21 -6.83 0.53 1.89 -4.40 1.67 f
masiyaların stabilləşməsində müxtəlif növ qarşılıqlı təsir enerjiləri müxtəlif cür rol oynayır. Leu-Leu dipeptid molekulunun qlobal konformasiyası f şeypinə uyğun gəlir. Bu R 21 R
konformasiyasının total enerjisi E tot = - 6.07 kkal/mol-dur. Hesablamalar nəticəsində məlum olmuşdur ki, R 21 R 21 qlobal konformasiyasının stabilləşməsində həlledici rolu qeyri-valent qarşılıqlı təsir oynayır. Bu konformasiyada qeyri-valent qarşılıqlı təsir enerjisi E q.v
= - 7.46 kkal/mol təşkil edir. Qlobal konformasiyanın destabilləşməsində elektrostatik qarşılıqlı-təsir enerjisi mühüm rol oynayır (EE=0.47 kkal/mol). Qlobal konformasiyaya yaxın növbəti konformasiyalar bunlardır: L 21 B 33 , R
22 R 31 , B 22 R 32 , R 23 R 21 konformasiyalarıdır. Bu konformasiyaları həm e həm də f şeypinə uygun gəlir və onların nisbi IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 119
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan enerjiləri uygun olaraq E tot = 0.67 kkal/mol, E tot = 1.42 kkal/mol, E tot = 1.44 kkal/mol, E tot = 1.49
kkal/mol təşkil edir. Konformasiyaların hamısına nəzər yetirdikdə bütün konformasiyalarda həlledici rolu qeyri-valent qarşılıqlı təsir oynayır. Bunu nəzərə alaraq Leu-Leu dipeptidinin qlobal və buna yaxın konformasiyalarda aminturşu qalıqlarının qalıqlararası qarşılıqlı təsiri müəyyənləşdirilmişdir və bu konformasiyalarda mümkün olan kiçik enerjili komformasiyada yaranan hidrogen rabitəsinin parametrləri müyəyyənləşridirmişdir və həmçinin qlobal konformasiyaya uyğun gələn quruluşda yaranan hidrogen rabitəsinin də parametrləri təyin edilmişdir. Hesablanan parametrlər aşağıdakı cədvəldə verilşişdir:
Konformasiya Atomun sıra nomrəsi Hidrogen rabitəsinin uzunluğu (A0) Hidrogen rabitəsinin enerjisi (kkal/mol) R 21 R 21
H 23………….
O 40
2,79 -0,11 L 21 B 33
H 23………..... O 41
2,67 -0,15 R 22 R 31
H 23……….…
O 40
2,80 -0,11 B 22 R 32
H 4…………...
O 21
2,69 -0,15 H 23…………. O 40
2,81 -0,10 R 23 R 21
H 23………….
O 40 2,82 -0,10
B 22 R 22
H 3 ……….O
21 2.50
-0.25 H 4 ............ O 21 2.53 -0.23 H 23 .......... O 40 2.81 -0.10
Cədvəldən göründüyü kimi qlobal konformasiyaya uyğun gələn fəza quruluşunda (R21R21) Leu2 NH……OCLeu2 arasında bir hidrogen rabitəsi yaranır. Beləliklə, nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə Leu-Leu dipeptid molekulunun optimal fəza quruluşu və konformasiya xassələri tədqiq edilmişdir. Hesablamalar nəticəsində molekulun qlobal konformasiyasının stabilləşməsində və destabilləşməsində həlledici rolu qarşılıqlı təsirlərin payları müəyyən edilmişdir.
PHE-PHE DİPEPTİD MOLEKULUNUN KONFORMASİYA DİNAMİKASI Ə.S.İLYASOVA Qafqaz Universiteti ilyasova_esli@mail.ru AZƏRBAYCAN G.Ə.AĞAYEVA Bakı Dövlət Universiteti gagayeva1@qu.edu.az AZƏRBAYCAN Nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə Phe-Phe dipeptid molekulunun fəza quruluşu və konformasiya xassələri təqdim olunan işdə tədqiq olunaraq modelləşdirilmişdir.Nəzəri konformasiya analizi üsulunda molekulun tam daxili potensial enerjisi onun tərkibində valent rabitəsində olmayan hər cüt atomların qarşılıqlı təsirlərin enerji qiymətlərinin cəminə bərabərdir. Peptid molekullarının konformasiya enerjisi mexaniki model əsasında valent bucaqları və valent rabitələri dəyişməz olmaq şərti ilə, qeyri-valent, torsion, elektrostatik qarşılıqlı təsirlərin və hidrogen rabitələrinin enerjilərinin cəmi kimi təyin olunmuşdur. Təqdim edilmiş Phe-Phe dipeptid molekulunun fəza quruluşu nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə polyar mühit üçün (dielektrik sabiti ε=10) tədqiq olunmuşdur. Hesablamalar nəticəsində molekulun aşağı enerjili konformasiyalarının ikiüzlü bucaqların qiymətləri, qalıqlararası qarşılıqlı təsir qüvvələrinin enerji payları və molekulun optimal fəza quruluşunun modeli müəyyən edilmişdir.Qeyd edək ki. Phe-Phe dipeptidi 43 atomdan və 9 fırlanma bucağından ibarətdir. Hesablamalar ikiüzlü bucaqların mümkün qiymətlərində aparılmışdır. Peptidlərin quruluşu
IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 120
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan konformasiya,forma və şeyplə xarakterizə olunur. Konformasiya lat.conformation-forma,yerləşmə deməkdir.Molekula daxil olan fraqmentlərin birqat rabitələr ətrafında rabitə uzunluqları dəyişmədən fırlanması nəticasində fəzada aldığı müxtəlif formalara konformasiya deyilir. Əsas zəncirin quruluşu molekulu təşkil edən ayrı-ayrı amin turşu qalıqlarının formaları ilə müəyyənləşir.
qiymətində, kkal/mol). N Konformasiya E q.v
(kkal/mol) E el (kkal/mol) E tor (kkal/mol) E üm (kkal/mol) E nis (kkal/mol) 1 B
1 R 1 -5.5 0.5 0.7 -4.3 2.1 2 B 1
2 -5.9
0.6 0.8 -4.4 2 3 B
1 R 3 -6.5 0.4 0.8 -5.2 1.2 4 B 2
1 -7.5
0.6 0.9 -5.9 0.5 5 B
2 R 2 -6.8 0.7 0.8 -5.2 1.2 6 B 2
3 -7.9
0.6 0.9 -6.5 0 7 B
3 R 1 -5.9 0.5 1 -4.5 2 8 B 3
0.4 0.9 -5 1.5 9 B
3 R 3 -6.4 0.4 0.9 -5 1.5
Mümkün olan kiçik enerjili komformasiyalarin stabilləşməsində müxtəlif növ qarşılıqlı təsir enerjiləri müxtəlif cür rol oynayır. Phe-Phe dipeptid molekulunun qlobal konformasiyası e şeypine uygun gelir Bu konformasiya B 2 R
konformasiyasıdır, totalenerjisi E tot
=-3.6 kkal/mol- dur.Hesablamalar nəticəsində məlum olmuşdur ki, B 2 R
qlobal konformasiyasının stabilləşməsində həlledici rolu qeyri-valent qarşılıqlı təsir oynayır. Bu konformasiyada qeyri-valent qarşılıqlı təsir enerjisi Eq.v=-4.8 kkal/mol teşkil edir.Qlobal konformasiyanın destabilləşməsində elektrostatik qarşılıqlı-təsir enerjisi mühüm rol oynayır (EE=0.3 kkal/mol).yğun gəlir. Qlobal konformasiyaya yaxın növbəti konformasiyalar R 3 L 3 , L
2 R 3 , R 3 R 3 , B
3 R 3 konformasiyalarıdır.Bu konformasiyalar e və f şeypinə uygun gəlir və onların nisbi enerjiləri uygun olaraq E tot =-3.41kkal/mol, E tot =-3.53kkal/mol, E tot
=-3.51kkal/mol, Etot=-3.44təşkil edir. Konformasiyalarin hamısına nəzər yetirdikdə bütün konformasiyalarda həlledici rolu qeyri-valent qarşılıqlı təsir oynayır. Cədvələ nəzər yetirdikdə məlum olur ki, e şeypinə uyğun kinformasiyalardan ən kiçik enerjiyə malik konformasiya B2R3 konformasiyasıdır, qalıqlararsı qarşılıqlı təsir kkl/mol təşkil edir.Bu konformasiyanın stabilləşməsində əsas rolu Van-der-Vaals qarşılıqlı təsiri oynayir E q.v
=-5.42kkl/mol. Destabilləşməsində isə elektrostatik qarşılıqlı təsirlər mühüm rol oynayır E e.s =0.72kkl/mol. e şeypinə uyğun növbəti kiçik enerjili konformasiyalar L 2 R 3 , L
1 B 2 konformasiyalarıdır.Bu konformasiyada da digər konformasiyalar kimi stabilləşmədə əsas rolu Van-der-Vaals qarşılıqlı təsiri E=-4.08kkl/mol,destabilləşməsində isə elektrostatik qarşılıqlı təsiri oynayır E=0.3kkl/mol təşkil edir.Bunlardan əlavə Phe-Phe dipeptid molekulunda yaranan hidrogen rabitələri,qlobal və ona yaxın optimal konformasiyalara uyğun ikiüzlü bucaqların qiymətləri təyin edilmişdir. Cədvəl-də ən kiçik enerji və ona yaxın bir neçə konformasiya üçün ikiüzlü bucaqların qiymətləri verilmişdir. Cədvəl 2. Phe-Phe molekulunun e şeypinə aid ən optimal konformasiyalarına uyğun ikiüzlü fırlama bucaqlarının qiymətləri. Amin turşu qalığı Əsas
zəncirin bucaqları
Yan zəncirin bucaqları
N φ Ψ ω χ
χ PHE
B 2 R 3 L
2 R 3 B 3 L 3
-115 50
-120 90
40 150
180 180
180 60
180 -60
90 90
90 PHE B
2 R 3 L 2 R 3
B 3 L 3
-100 -140 50
-33 -60
60 - - - 60 -60 -60
90 90
90 IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 121
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan Cədvəldə e şeypindən hər formaya aid iki en kiçik enerjili konformasiya üçün ikiüzlü bucaqıarının qiymətləri verilmişdir.
Phe-Phe dipeptid molekulunun konformasiya analizi nəticəsində aşağıdakı nəticələr alınmışdır:1. Nəzəri konformasiya analizi üsulu ilə Phe-Phe dipeptid molekulunun mümkün olan bütün konformasiyaları və hər konformasiyaya uyğun gələn enerjilər müəyyənləşdirilmişdir.2. Phe-Phe dipeptid molekulunun mümkün olan 2 şeypində (e və f) enerjinin şeyplərə və konformasiyalara görə paylanması müəyyənləşdirilmişdir. 3. Phe-Phe dipeptid molekulunun mümkün olan konformasiyala- rının reallaşmasında rol oynayan bütün növ (qeyri-valent, torsion, elektrostatik) enerjilərin qiymətləri təyin olunmuşdur.4. Phe-Phe dipeptid molekulunun mümkün olan 2 şeypində (e və f) kiçiken enerjili konformasiyaların reallaşmasında rol oynayan qalıqlararası qarşılıqlı təsir enerjiləri təyin edilmişdir.5. Phe-Phe dipeptid molekulunun konformasiya analizi dielektrik əmsalının ε=10 qiymətində aparılaraq müəyyən olunmuşdur ki,qlobal konformasiya f şeypinə uyğun konformasiyadır. 6. Dipeptid mole- kulunun ən kiçik enerjiyə malik konformasiyalarına uyğun ikiüzlü bucaqların qiymətləri təyin edilmişdir.7. Phe-Phe dipeptid molekulunda yaranan hidrogen rabitələri və bu rabitələrin e və f şeypində yarandığı məlum olmuşdur.
EFFECT ON STRUCTURAL PROPERTIES BY REPLACEMENT OF Ca→Ba IONS IN Ca x Ba 1-x Ga 2 S 4 COMPOUNDS Tural NAGHIYEV Institute of Physics of Azerbaijan National Academy of Sciences tural@nagiyev.net AZERBAIJAN
In the present study, we focus on the investigation of the role of the earth-alkali elements on the structural properties of the high efficiency luminescent chalcogenide semiconductor compounds. Ba and Ca thiogallates have a 3.0 – 4.4 eV band gap energy and unlike binary gallates are less sensitive to hydrolysis and can implement large concentrations of active centers in crystal lattice due to close radii of M
2+ and REE ions. The aim of this research is to obtain and investigation structural properties of IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 122
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan Сa x Вa 1-x
Ga 2 S 4 :Eu (0.1 ≤ х ≤ 0.9) compounds to determine the possibility of using them as phosphors for display devices, high-brightness white LEDs. In first time, Сa x Вa
Ga 2 S 4 (0.1 ≤ х ≤ 0.9) solid solutions synthesized by solid state reaction from the BaS, CaS, Ga 2 S 3 binary compounds taken in stoichiometric ratios. Synthesis was carried out in quartz ampoules evacuated to 10-4 Torr in single-temperature furnace at 1373 K for 2 h. After synthesis, the resulting compounds exposed annealing for 24 h. at 973 K. The crystal structure of chalcogenide semiconductor BaGa 2 S 4 is cubic with the space group Pa3. At ambient conditions, the lattice parameters are a = 12.660 Å. The crystal structure of CaGa 2 S 4 is
orthorhombic with the space group Fddd. At ambient conditions, the lattice parameters are a = 20.122, b = 20.090 and c = 12.133Å. Recently by the different synthesis method P21/a space lattice and a = 6.841(3), b = 27.069(9), c = 7.231(3) Å, β = 109.413(5)° lattice parameters monoclinic symmetrical structure have been got. To perform X-ray diffraction study, powder samples were prepared from these crystals to be analyzed on a D8 ADVANCE powder diffractometer (Bruker) with the following parameters: 40 kV, 40 mA, Cu Kα radiation (λ = 1.5406 Å). The analysis was performed in a TTK723K thermal chamber in the room temperature. The diffraction data was analyzed by the Rietveld method using the FullProf program. The crystal structure of Сa x Вa
Ga 2 S 4 solid solution varies with the amount of Ca 2+ ions and cubic → orthorhombic phase transition takes place with the increase of x value. It was found that replacement of Ba→Ca changed has practically effect on the structural and transport properties: indeed both compounds have different crystal structure. Established that crystal structure Сa x Вa 1- x Ga 2 S 4 compound in case of x = 0.1 and 0.2 are corresponded 2 different phase with the cubic crystal structure with space group Pa3. In case of x = 0.3, 0.4, 0.5, 0.6 and 0.7 compounds are crystal structure have 3 different phase. Both of these phases cubic crystal structure with space group Pa3 and third phase is orthorhombic symmetry with space group Fddd. The crystal structure with one phase of orthorhombic symmetry and space group Fddd was defined for Сa x Вa 1-x Ga 2 S 4 with x equal to 0.8 and 0.9. Thus, the crystal structure of Сa x Вa 1-x Ga 2 S 4 solid solutions varies with the amount of Ca 2+ cations and phase transition from cubic to orthorhombic takes place with increase of x value. The lattice parameters and atomic coordinates of Сa x Вa
Ga 2 S 4 (x= 0.1-0.9) calculated for each phases. This work was supported by the Science Development Fund under the President of the Republic of Azerbaijan - Grant № EIF-BGM-2-BRFTF-1-2012/2013-07/02/1. IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 123
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan PROCEEDINGS SECTION I NATURAL SCIENCES Mathematics IV INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS 124
Qafqaz University 29-30 April 2016, Baku, Azerbaijan ÜÇÜNCÜ TƏRTİB DİSKRET MULTİPLİKATİV TÖRƏMƏLİ TƏNLİK ÜÇÜN KOŞİ MƏSƏLƏSİNİN HƏLLİ Yüklə 22,28 Mb. Dostları ilə paylaş:
|