Protein yang diproteksi ( dengan melapisi formalin) akan melewati rumen tanpa mengalami pemecahan oleh mikroorganisme rumen. Protein yang diproteksi tersebut meningkatkan jumlah protein pakan by pass dan langsung masuk ke dalam abomasum sebagai intake protein. Protein by pass ini penting dan perlu dilakukan apabila dibutuhkan jumlah protein yang sangat tinggi untuk sapi perah dengan produksi tinggi pada awal laktasi.
Lemak yang masuk ke dalam rumen akan dihidrogenasi oleh mikroorganisme rumen. Beberapa lemak dimetabolisme dan digunakan untuk keperluan mikroorganisme sendiri. Hidrolisis trigliserol menjadi asam-asam lemak dan gliserol juga terjadi dalam rumen. Pada prinsipnya gliserol difermentasi menjadi propionat tetapi asam lemak rantai panjang dapat melaju ke intestinum untuk dicerna.