Molekulyar dinamika və metadinamika



Yüklə 0,49 Mb.
Pdf görüntüsü
səhifə1/8
tarix22.12.2022
ölçüsü0,49 Mb.
#77205
  1   2   3   4   5   6   7   8
2.2.Molekulyar dinamika, (113-125)



Molekulyar dinamika və metadinamika 
113
2.2. MOLEKULYAR DİNAMIKA VƏ METADİNAMİKA 
Molekulyar dinamika (MD) – qarşılıqlı təsirdə olan atom və 
hissəciklərin zamandan asılı evolyusiyasının onların hərəkət tənlik‐
lərinin inteqrallanması ilə izlənməsidir. 
Metadinamika–molekulyar dinamikanın genişləndirimiş ver‐
siyası, çevrilmələin ilkin prinsiplər əsasında superkompüter model‐
ləşməsidir. Metadinamika nizamsız və nizamlı hallar arasında keçidləri 
daha yaxşı modelləşdirir. Bu ifadələrin başa düşülməsi üçün bu 
metodlarla aparılmış bəzi tədqiqatları nəzərdən keçirək. [1] işində 
[2,3] işlərindəki ideyalar inkişaf etdirilərək naftalosianinin izomer‐
ləşmə reaksiyası əsasında molekulyar keçid modelləşdirilmişdir. 
Molekulyar keçid skanedən tunel mikroskopunun cərəyanı ilə 
stimullaşdırılmışdır.
Gibbs sərbəst enerjisinin səthi və reaksiyanın gedişi meta‐
dinamika üsulu ilə Car‐Parrinello 
1
"CPMD" molekulyar dinamikasının 
ədədi kvantmexanika kodu çərçivəsində təsvir edilir. Hesablamalar 
superkompüter IBMBlueGene/P vasitəsi ilə aparılmışdır. 
Skanedən tunel mikroskopu 
2
(STM) cərəyanın təsiri ilə 
nafatalosianin molekulunda hidrogen izomerləşmə reaksiyasının 
enerji baryerinin verilən koordinat dəyişənlərində hündürlüyü 
tapılmışdır.
Təcrübələr göstərdi ki, molekulyar hidrogen izomerləşmə 
prosesi molekulun quruluşu dəyişmədən baş verir. Nafatalosianinin 
daxilindəki iki hidrogen atomunun qeyri‐stabilliyi ikisəviyyəli sistemlə 
ifadə edilir. Nafatalosianin molekulu azot, karbon və hidrogen 
atomlarından ibarətdir (şəkil 2.2.1). Hidrogen izomerləşməsi 
reaksiyasının mahiyyəti ondan ibarətdir ki, molekulun mərkəzində 
azot atomlarına birləşmiş iki hidrogen atomu, STM‐un yaratdığı 
xarici potensialın təsirilə, digər iki azot atomlarına keçir (şəkil 
2.2.1ab). Bu keçid prosesi molekulun olduğu müstəvidə 90
0
1
CPMD–Car‐Parrinello molekulyar dinamikası [4]
2
STM–skanedən tunel mikroskopu


Molekulyar dinamika və metadinamika 
114
çevrilməsinə ekvivalentdir. Hər iki izomerin həndəsi quruluşu eynidir 
(şəkil 2.2.1cd). 

Yüklə 0,49 Mb.

Dostları ilə paylaş:
  1   2   3   4   5   6   7   8




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©azkurs.org 2024
rəhbərliyinə müraciət

gir | qeydiyyatdan keç
    Ana səhifə


yükləyin