1 friday, april 19 Biochemistry and Molecular Biology asbmb graduate and postdoctoral travel award keynote lecture special Session

J.W. Tullai, S. Sepulveda, J.F. Brennan, M.E. 

Moss, F.J. Naya and G.M. Cooper. Boston Univ.

C51 

547.6 

Argonaute 2-loaded promoter-targeted double 

stranded RNA mediates gene activation by interacting with the 

core transcriptional machinery. 

V. Portnoy and L-C. Li. UCSF.

C52 

547.7 

Investigating neurogenesis with biosensors 

directed at key transcription factors. 

M.R. Stoddard and A.J. 

Bonham. Metropolitan State Univ. of Denver.

548.  TRANSCRIPTIONAL ASSEMBLIES AND 

MECHANISMS

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C53 

548.1 

Differential contacts of the 4.5 Myb repeats of 

SNAP190 with the DNA of U1 and U6 snRNA gene promoters. 

W.E. Stumph, Y.S. Kang and M. Kurano. San Diego State 

Univ.

549.  TRANSCRIPTIONAL INITIATION

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C54 

549.1 

Activation of the glucocorticoid receptor by 

dexamethasone enhances BHV-1 productive infection. 

T. 

Ahlers, C. Jones and D. Sinani. Wayne State Col. and Univ. of 

Nebraska-Lincoln.

C55 

549.2 

Mechanistic studies of transcription initiation 

by the yeast mitochondrial RNA polymerase. 

A.P. Deshpande 

and S.S. Patel. UMDNJ, Piscataway.

C56 

549.3 

Characterization of the interaction between 

Rrn3 and rpa43: identification of a peptide that inhibits rDNA 

transcription and cell growth. 

L. Rothblum, Y. Penrod and K. 

Rothblum. Univ. of Oklahoma Hlth. Sci. Ctr.

550.  TRANSCRIPTIONAL REGULATION

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C57 

550.1 

Isolation and characterization of the TATA 

binding protein of Taenia solium. 

O. Rodríguez-Lima, L. 

Jiménez, A. Zarain-Herzberg and A. Landa. UNAM, Mexico 

City.

C58 

550.2 

Dimer interface of Deinococcus radiodurans 

HucR communicates DNA and ligand binding. 

D.K. Deochand, 

I.C. Perera and A. Grove. LSU.

C59 

550.3 

Functional variants of MARCO modulate 

susceptibility to respiratory syncytial virus. 

J.M. Marzec, J.M. 

Ciencewicki and S.R. Kleeberger. NIEHS, NIH, Research 

Triangle Park.

SUNDAY BIOCHEMISTRY

152

C60 

550.4 

Functional characterization of the Notch 

response element: mastermind selectivity and interaction with 

the TATA box determines activation strength. 

C.A. Ramos, T.M. 

Burke and J.B. White. San Jose State Univ.

C61 

550.5 

Expression of the mouse Lin28a gene is 

epigenetically regulated by histone modification. 

A.L.Y. Pang, 

A.C. Title and O.M. Rennert. NICHD, NIH.

C62 

550.6 

Transcriptional regulation of trocarin D, a 

prothrombin activator from Tropidechis carinatus. 

X. Han, 

S. Kwong, R. Ge, P. Kolatkar and R.M. Kini. Natl. Univ. of 

Singapore and Genome Inst. of Singapore.

C63 

550.7 

The role of zinc binding protein-89 in basal and 

IL-1 induced expression of matrix metalloproteinase-3. 

S.N. 

Scianni, G. Gorski, S. Foster and R. Borghaei. Philadelphia 

Col. of Osteo. Med.

C64 

550.8 Withdrawn.

C65 

550.9 

p54nrb/NONO regulates glucocorticoid 

production by controlling the capacity for cAMP signaling. 

J. 

Yang and M.B. Sewer. Skaggs Sch. of Pharm. and Pharmaceut. 

Sci., UCSD.

C66 

550.10  Histone deacetylase inhibitors upregulate 

natriuretic peptide receptor-A gene transcription via histone 

modifications and Sp1 acetylation. 

P. Kumar, S. Neerukonda, 

V. Nguyen and K.N. Pandey. Tulane Univ. Hlth. Sci. Ctr.

C67 

550.11  gln3 Mutations dissociate responses to 

nitrogen catabolite repression and rapamycin inhibition of 

TorC1. 

R. Rai, J.J. Tate and T.G. Cooper. Univ. of Tennessee 

Hlth. Sci. Ctr., Memphis.

C68 

550.12  Transcriptional regulation of the sodium-

coupled neutral amino acid transporter (SNAT2) by 

17

b-estradiol.  L. Velazquez-Villegas, V. Ortiz, D. Ordaz-

Rosado, R. Garcia-Becerra, F. Larrea, N. Torres and A.R. 

Tovar. UNAM and Salvador Zubiran Natl. Inst. of Med. Sci. and 

Nutr., Mexico City.

C69 

550.13  Enhancement of miR-182 expression by Sp1 

promotes lung cancer cell progression. 

J-J. Hung. Natl. Cheng 

Kung Univ., Taiwan.

C70 

550.14  Comparative analysis of transcriptional 

regulation by Ascl1 and Neurog2. 

M. Uhler, T. Redmond, H. 

Huang, R. Thompson and D. Turner. Univ. of Michigan.

C71 

550.15  Capturing the transient, in vivo binding partners 

of transcriptional activators using a genetically incorporated 

photo-crosslinking amino acid. 

A. Dugan and A.K. Mapp. Univ. 

of Michigan.

C72 

550.16  Corepressors LCoR and KAP1 form a complex 

with the transcription factor ZBRK1 to silence FGF2 gene 

expression and maintain breast cancer cell viability. 

M.R. 

Calderon, M. Verway, S. Mader and J.H. White. McGill Univ. 

and Univ. of Montreal.

C73 

550.17  Regulation of NF

kB-dependent interleukin-8 

in human macrophages by nuclear I

kBa and proteasome 

inhibition. 

S. Sanacora, S. Manna, B. Singha, T-P. Chang, 

S. Ramaswami and I. Vancurova. St. John’s Univ., NY and 

Columbia Med. Sch.

C74 

550.18  Purification and characterization of a metal-

dependent regulator protein from Thermobifida fusca. 

J.B. 

Granger, T. Nguyen, Z. Lu, J.B. Ferguson, P. Santa Maria 

and W.R.P. Novak. Wabash Col.

C75 

550.19  A DNA damage-inducible response in 

Acinetobacter baumannii. 

A.E. MacGuire. Northeastern Univ.

C76 

550.20  The JmjC domain-containing regulator Gis1 is 

regulated by heme and oxygen. 

T. Cao, A. Shah, S. Lal and L. 

Zhang. Univ. of Texas at Dallas.

C77 

550.21  The Wnt/

b-catenin/TCFf-4 pathway 

upregulates HMGA1 expression in colon cancer. 

T.F. Sumter, 

B. Bush, A. Brock, J. Deng and R. Nelson. Winthrop Univ.

C78 

550.22  Differential expression of MMP-2 and annexin 

V in normal and neoplastic mouse bone cells in response 

to direct expression of angiotensin II. 

K. Bosch, M. Cain, C. 

Seigneur and M. Chernin. Bucknell Univ.

551.  RNA FUNCTION AND PROTEIN SYNTHESIS

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C79 

551.1 

mTOR complex 2 phosphorylates IGF2 mRNA 

binding protein1 cotranslationally to promote IGF2 production 

and the proliferation of mouse embryonic fibroblasts. 

N. Dai 

and J. Avruch. Massachusetts Gen. Hosp.

C80 

551.2 

Study on the anti-atherosclerotic mechanisms 

of immune tolerance induced by heat shock protein 60. 

C. Hao, 

H. Duan, S. Li, S. Wang, C. Xiao, X. Liu, L. Xi and F. Wang. 

First Clin. Col. of Shanxi Med. Univ., China.

C81 

551.3 

The potential role of simian virus 40 polyA 

sequence to mediate stress-inducible mRNA translation. 

N. 

Wong and T.W. Lui. The Univ. of Hong Kong.

C82 

551.4 

Understanding the basis of pathogenicity 

in the R592W mutant of human mitochondrial alanyl-tRNA 

synthetase. 

J. Borchardt, K. France and J. Chihade. Carleton 

Col., MN.

C83 

551.5 

Increased protein synthesis of IRES containing 

mRNAs, that induce cell survival and proliferation, by the 

daidzein metabolite equol may contribute to breast cancer 

malignancy. 

C. Parra and S. Dharmawardhane. Univ. of 

Puerto Rico Med. Sci. Campus.

C84 

551.6 

Binding of eukaryotic initiation factor 4F to 

barley yellow dwarf virus 3’ UTR correlates well with protein 

synthesis efficiency. 

B. Banerjee and D.J. Goss. Hunter Col. 

and Grad. Ctr., CUNY.

C85 

551.7 

Barley yellow dwarf virus utilizes a novel 

strategy for translation initiation. 

S. Das Sharma and D.J. 

Goss. Hunter Col. and Grad. Ctr., CUNY.

C86 

551.8 

Mechanism of activator (eIF4F) and suppressor 

(IRP) binding to iron responsive element mRNA. 

J. Ma, M. 

Khan, W.C. Merrick, E.C. Theil and D.J. Goss. Hunter Col. 

and Grad. Ctr., CUNY, Case Western Reserve Univ., Children’s 

Hosp. Oakland Res. Inst. and Univ. of California, Berkeley.

C87 

551.9 

Toward a better understanding of canonical and 

non-canonical cap-binding complex subunits of Arabidopsis 

thaliana. 

R.M. Patrick, L.K. Mayberry, G. Choy, M.C. Gebhard 

and K.S. Browning. Univ. of Texas at Austin.

C88 

551.10  Selective mRNA translation by eIF2 

phosphorylation during ER stress. 

R.C. Wek, T.D. Baird and 

L.R. Palam. Indiana Univ. Sch. of Med.

C89 

551.11  DNA based folding bio-sensors that are 

capable of detecting transcription factors involved in cancer 

progression by expressing recombinant TATA binding protein. 

Y.C. Reyna and A.J. Bonham. Metropolitan State Univ. of 

Denver.

BIOCHEMISTRY SUNDAY

153

S

U

N

C90 

551.12  Gene expression of (pro)renin receptor 

is downpregulated in heart of transgenic mice with acute 

myocardial infarction. 

A.A. Ribeiro, R.P. Amorin, M.J.S. 

Fernandes, M.C. Irigoyen, J.L. Pesquero and D.E. Casarini. 

Fed. Univ. of São Paulo, Univ. of Sao Paulo and Fed. Univ. of 

Minas Gerais, Brazil.

C91 

551.13  Binding characteristics of TAR RNA and Tat-

cyc peptide from the human immunodeficiency virus. 

J. Sun 

and M. Najib. San Jose State Univ.

552.  MAKING AND USING RNA IN THE NUCLEUS

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C92 

552.1 

NOL11, implicated in the pathogenesis of 

North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-

rRNA transcription and processing. 

S. Baserga, E. Freed, J-L. 

Prieto, K. McCann and B. McStay. Yale Sch. of Med. and Natl. 

Univ. of Ireland Galway.

553.  PROTEIN MODIFICATION, TRAFFICKING AND 

DEGRADATION

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C93 

553.1 

Rab4 GTPase regulates cell surface expression 

of hERG channels through Nedd4-2. 

Z. Cui and S. Zhang. 

Queen’s Univ., Canada.

C94 

553.2 

Ubiquitin and cell cycle regulation of Golgi 

membrane dynamics. 

Y. Wang, D. Tang and X. Zhang. Univ. of 

Michigan.

C95 

553.3 

Stabilization of OCT4 by hypoxia mimetics, 

nickel and cobalt. 

Y. Yao and W. Dai. NYU, Tuxedo.

C96 

553.4 

Stabilizing rescued delF508 CFTR at the 

plasma membrane by potentiation of its interaction with Na

+

/H

+

 

exchanger regulatory factor 1. 

K. Arora, C.S. Moon, W. Zhang, 

A. Ren, S. Yarlagadda, C. Sinha and A.P. Naren. Univ. of 

Tennessee Hlth. Sci. Ctr., Memphis.

C97 

553.5 

Influence of proteasomal degradation of RNA-

binding protein dTIS11 on ARE-mediated decay. 

L. Vo ngoc, V. 

Kruys and C. Gueydan. Univ. Libre de Bruxelles.

C98 

553.6 

Interaction of TAG1 and CASPR2, proteins 

associated to autism disorder? 

E.N. Rubio-Marrero, G. 

Falivelli, H. Kim and D. Comoletti. Child Hlth. Inst. of New 

Jersey, New Brunswick and UCSD.

C99 

553.7 

N-linked glycosylation in the ATP binding 

cassette class A3 transporter. 

S. Mulugeta, M. Zhao, A. 

Hawkins, P. Wang, P. Zhang, L. Gonzales, S.H. Guttentag 

and M.F. Beers. Univ. of Pennsylvania and Children’s Hosp. of 

Philadelphia.

C100 

553.8 

Study of self catalyzed protein glycation on 

monoclonal antibody A. 

H. Liu, Y. Yang, H. Flores, B. Zhang, T. 

Swartz and T. Patapoff. Genentech.

C101 

553.9 

Quantitative internalization kinetics of the green 

fluorescence protein-tagged guanylyl (guanylate) cyclase/

natriuretic peptide receptor-A in human embryonic kidney-293 

cells. 

I. Mani, R. Garg, V.A. Nguyen and K.N. Pandey. Tulane 

Univ. Hlth. Sci. Ctr.

C102 

553.10  A His-rich region in the linker region of PAM 

may sense lumenal pH. 

K.S. Vishwanatha, R.E. Mains and 

B.A. Eipper. Univ. of Connecticut Hlth. Ctr.

C103 

553.11  Changes in synapsin 1 phosphorylation and 

tubulin acetylation in mice deficient in protein L-isoaspartyl 

methyltransferase. 

Z. Qin and D.W. Aswad. Univ. of California, 

Irvine.

C104 

553.12  Peptidylarginine deiminase modulates the 

physiological roles of enolase via citrullination. 

E-K. Choi, B. 

Jang, Y-C. Jeon, A. Ishigami, N. Maruyama, R.I. Carp and 

Y-S. Kim. Ilsong Inst. of Life Sci. , Hallym Univ., South Korea, 

Tokyo Metro. Inst. of Gerontol., New York State Inst. for Basic 

Res. in Develop. Disabil. And Hallym Univ. Col. of med.

C105 

553.13  Degradation of the transcription factor Nrf2 in 

promyelocytic leukemia-nuclear bodies. 

D. McIntosh and I. 

Arinze. Meharry Med. Col.

C106 

553.14  Activation of muscarinic receptor increases 

cardiac potassium hERG channel through phosphorylation of 

E3 ubiquitin ligase Nedd4-2. 

T. Wang and S. Zhang. Queen’s 

Univ., Canada.

C107 

553.15  Serum and glucocorticoid inducible kinase 

regulates hERG channels through inhibition of Nedd4-2 and 

activation of Rab11 recycling endosomes. 

S.M. Lamothe and 

S. Zhang. Queen’s Univ., Canada.

C108 

553.16  The effect of n-butyl-deoxynojirimycin on the 

structure, function and trafficking of intestinal glycoproteins. 

M. 

Amiri and H.Y. Naim. Univ. of Vet.Med. Hannover, Germany.

C109 

553.17  Landscape of the PARKIN-dependent ubiquitin 

modified proteome in response to mitochondrial depolarization 

defined through quantitative proteomics. 

S.A. Sarraf, M. 

Raman, V. Guarani-Pereira, M.E. Sowa, E.L. Huttlin, S.P. 

Gygi and J.W. Harper. Harvard Med. Sch.

C110 

553.18  Investigating the roles of Wntless (wls) isoforms 

in Wingless signaling. 

N.J. Lombardi and E. Selva. Univ. of 

Delaware.

C111 

553.19  Enhancement of ubiquitin conjugating activity 

promotes the clearance of aggregation-prone mutant proteins 

in living cells. 

F. Shang, Z. Liu, A. Taylor, X. Zhang, M. Wu, Y. 

Liu and J.J.N. Liang. USDA at Tufts Univ., Sun Yat-sen Univ., 

China and Brigham and Women’s Hosp., Harvard Univ.

C112 

553.20  Transthyretin regulates lysosomal degradation 

of hippocampal 14-3-3

z. M. Vieira and M.J. Saraiva. IBMC, 

Porto, Portugal.

C113 

553.21  Cross-presentation of peptides chaperoned by 

heat shock protein gp96. 

S.S. Phillips and R.J. Binder. Texas 

Southern Univ. and Univ. of Pittsburgh.

C114 

553.22  Role of membrane-proximal basic residues in 

cell surface trafficking of GPR15. 

S. Shikano, J. Bernstein 

and Y.  Okamoto. Univ. of Illinois at Chicago.

C115 

553.23  Characterization of the non-catalytic inhibitory 

effect of Ubp6 on proteasome function.

 A. Roychowdhury, J. 

Robert, B-H. Lee and D. Finley. Harvard Med. Sch.

C116 

553.24  Polarized release of TCR-enriched 

microvesicles at the center of the T cell immunological synapse. 

M. Dustin. NYU Sch. of Med.

C117 

553.25  Casein kinase 1

d/ε regulates clathrin- and 

actin-mediated endocytosis.  

Y.C. Peng, A. Grassart, R. Lu, A. 

Michelot, C. Wong, J. Yate III, G. Barnes and D. Drubin. Univ. 

of California, Berkeley and The Scripps Res. Inst.

SUNDAY BIOCHEMISTRY

154

C118 

553.26  Unraveling the specificity in the ubiquitin 

system. 

D. Komander. MRC Lab. of Molec. Biol.

554.  MECHANISMS OF BACTERIAL AND VIRAL 

PATHOGENESIS

Poster

s

un

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C119 

554.1 

Variability in fusogenic activity of human 

metapneumovirus fusion protein from different strains. 

E. 

Klimyte, A. Chang and R. Dutch. Univ. of Kentucky.

C120 

554.2 

Public health model for mitigation of 

antimicrobial resistance. 

S. Kannan and J. Martinez. 

Southwest Texas Junior Col. and Fort Duncan Reg. Med. Ctr., 

Eagle Pass, TX.

C121 

554.3 

Manipulation of host cell signaling by bacterial 

FIC proteins. 

K. Pieles, A. Harms and C. Dehio. Bioctr., Univ. 

of Basel.

C122 

554.4 

Analysis of the replication proteins and 

satellites of the turnip crinkle virus. 

J.A. Zinskie, K. Myers, 

M. Assiri, T. Baumstark and M. Bruist. Univ. of the Sci.in 

Philadelphia and Cornell Univ.

C123 

554.5 

Using molecular dynamics in modeling 

broadly neutralizing antibodies against influenza viruses and 

its implications for developing a “universal flu vaccine”. 

W. 

LaCosta, S. Beckman, J. Friend, E. Krautler, L. Pacific, S. 

Pulapura, P.C. Shim, T. Herman, W. Wriggers, H. Xu and L. 

De. The Pingry Sch., Martinsville, NJ, Milwaukee Sch. of Engin. 

and DE Shaw Res., New York.

C124 

554.6 

Recognition of the WXG substrate YukE by the 

type VII secretion system in Bacillus subtilis. 

T.A. Sysoeva, 

L.A. Huppert, T.L. Ramsdell, S.M. Fortune and B.M. Burton. 

Harvard Univ. and Harvard Sch. of Publ. Hlth.

C125