Testy ve forenzní genetice
Testy DNA mají dnes své místo i v kriminalistice a soudním lékařství. Genetické metody dnes nabízejí
dříve netušené moţnosti v oblasti identifikace osob, nicméně ne vše funguje vţdy tak snadno jako v
televizních seriálech. Například kontaminace materiálu či jeho nedostatek, respektive nevhodnost pro
genetickou analýzu, mohou způsobit, ţe i ty nejlepší metody selţou. S namnoţením genetického
materiálu pro analýzu pomáhá metoda PCR.
V rámci identifikace osob a určování příbuzenského poměru (viz testy otcovství níţe) se vyuţívá
tzv.
STR
(
Short Tandem Repeats
)
–
krátkých tandemových repetic (někdy označované
jako
mikrosatelity
). Jde o specifické sekvence DNA, které se vyskytují (ve velkém mnoţství)
rozptýlené v genomu. Jedná se o repetice (nejčastěji CA dvojice nukleotidů) jejichţ počet opakování v
konkrétním lokusu je pro kaţdého jedince specifický. Konkrétní počet repetic se zjistí díky metodě
PCR a následné elektroforéze fragmentů. Lze tedy vytvořit spolehlivý genetický profil jedince.
Přesnost je velmi vysoká –
hovoří o tom jak neoficiální název této metody (
DNA fingerprinting
–
doslova genetické otisky prstů), tak skutečnost, ţe jde o soudy běţně uznávaný důkaz.
Základní dva úkoly forenzní genetiky jsou
identifikace pachatele
a
identifikace oběti
. Pro identifikaci
pachatele lze pouţít veškerý genetický materiál (krev, vlasy, sperma…), zanechaný na místě činu, na
těle oběti apod. Genetický profil takto
získaného vzorku je třeba porovnat s materiálem získaným od
podezřelého, či z DNA registru pachatelů (je
-
li v příslušné zemi zřízen).
Pokud není moţná identifikace těla oběti standardními metodami (vizuální identifikace, otisky prstů,
zubní karta aj.), je
moţné pouţít test DNA (opět za předpokladu, ţe lze zajistit dostatečné mnoţství
genetického materiálu vhodného pro analýzu). K porovnání je třeba nalézt vzorek DNA prokazatelně
patřící oběti, nejčastěji zanechaný na osobních předmětech (hřeben, oděv, hygienické potřeby…). V
případě, ţe takovýto vzorek nelze zajistit, je moţné porovnat vzorek DNA oběti se vzorkem od
některého z příbuzných (musí jít samozřejmě o pokrevního příbuzného).
Poznámka:
získávání materiálu pro test DNA z mrtvých těl není výsadou pouze forenzní genetiky. I v
klinické genetické praxi je občas nutné (v rámci komplexního vyšetřování širší rodiny; k tomuto
postupu se přistupuje zejména u rodinného výskytu nádorového onemocnění s moţnou dědičnou
příčinou) poţádat o vzorek tkáně zemřelého (s takovou ţádostí je nutné se obrátit na patologický
ústav, kde byl zemřelý pitván, a kde je šance, ţe byly uloţeny tkáňové bločky určené pro histologické
vyšetření); pokud však nebyla provedena pitva či nebyly uschovány vzorky tkáně, potom nezbývá neţ
se
bez vzorku tohoto jedince obejít.
Testy otcovství
Tímto názvem se označuje nejčastěji prováděná varianta příbuzenských testů. Vychází ze starého
známého pravidla –
matka je vţdy známá, otec je neznámý. Nicméně v potřebném případě (třeba při
identifikaci bi
ologické matky adoptovaného dítěte) lze tento typ testů provést i jako "test mateřství".
Princip je totiţ stejný a většinou odpovídá výše uvedenému genetickému profilu, získaného pomocí
PCR amplifikace STR repetic. Jelikoţ potomek získává polovinu své celkové genetické informace od
kaţdého z rodičů, můţeme vysledovat, po kterém rodiči má které STR repetice. S kaţdým z rodičů by
měl potomek mít právě 1/2 shodné DNA (v tomto případě STR repetic). Pokud analýza prokáţe, ţe
rodič nemá s potomkem shodné STR repe
tice
–
je otcovství (respektive mateřství) vyloučeno.
Testy otcovství jsou dnes běţně nabízeny řadou soukromých firem (více či méně) specializovaných na
genetické testování. Test stojí několik tisíc korun a je běţné provést jej anonymně. Testovací sadu
(ob
sahující nejčastěji pomůcky k provedení bukálního stěru pro dvě osoby –
dítě a testovaného
rodiče) je moţné objednat si přes internet a materiál k vyšetření je moţné zaslat poštou. To sice
zvyšuje komfort zákazníka, při špatném zacházení ale můţe dojít ke kontaminaci vzorku. Obecně je
(vzhledem k závaţnosti moţných následků testu) dobré na tomto testu nešetřit a raději si zaplatit
draţší test, ovšem
u certifikované firmy
, která má v této oblasti jiţ určité zkušenosti.
Etická otázka těchto testů je problematická. Testy otcovství mají totiţ řadu odpůrců, kteří tvrdí, ţe
podobné testy vedou často k rozvratu jinak spokojených rodin. Na druhou stranu je nutné si uvědomit,
ţe jedinou vadou správně provedeného testu otcovství je ta skutečnost, ţe dokáţe odhalit pra
vdu.
Genografické testy
Jde o relativní novinku v oblasti genetického testování. Tyto testy, které lze objednat u soukromých
firem, mají přiblíţit území, ze kterého nejpravděpodobněji pocházel váš předek a další doplňující
informace. Praktické vyuţití této
informace není velké (ačkoliv v budoucnosti moţná i tyto informace
budou přínosem pro personalizovanou medicínu), ovšem pro zájemce (genealogy či antropology, byť
jen amatérské) můţe mít cenu velkou.
Pro tyto testy je zapotřebí izolovat z DNA takové sekvence, které se za mnoho století relativně
nezměnily, a jejichţ přenos z rodičů na děti po mnoho generací dnes funguje jako pojítko s minulostí.
U muţské linie se pouţívá několik vybraných
haplotypů z chromosomu Y
. Tento chromosom se
dědí výhradně z otce na syna a tyto sekvence zůstávají v průběhu generací (téměř) neměnné.
U ţen je moţné stopovat
mitochondriální DNA
(
mtDNA
), která se pro změnu dědí pouze po matce
(dostávají ji všechny děti oné matky).
Prediktivně
-
genetické testy
Prediktivní genetika
je odvětví genetiky specializující se na
odhad rizik
(určitých chorob) na základě
vyšetření DNA. V budoucnosti se dá očekávat, ţe by na základě komplexního genetického vyšetření
bylo moţné předpovědět riziko vzniku určitých
multifaktoriálně dědičných chorob
(jako jsou
choroby kardiovaskulárního systému apod.).
Jiţ dnes je moţné si podobné testy u některých firem objednat. Řada vědců a odborných společností
ovšem upozorňuje, ţe problematika komplexních chorob je stále nedořešená. Výpovědní hodnota
takovýchto testů je
tedy nejistá a odborníci před nimi prozatím varují.
Mikrobiologické testy
Na závěr je vhodné zmínit se o genetických testech, vyuţívaných v klinické mikrobiologii. Diagnostika
různých patogenních mikroorganismů pomocí molekulárně
-
genetických metod (nejčastěji pomocí
metod PCR, LCR aj.) výrazně urychlila diagnostiku některých chorob, respektive přítomných
patogenů. Na druhou stranu, při klasické kultivaci bakterií na agaru lze rovnou zjistit citlivost patogenu
na antibiotika, coţ metoda PCR nedokáţe.
3)
Vyšetření karyotypu
Indikace k vyšetření karyotypu
V rámci
klinické genetiky
se karyotyp vyšetřuje relativně často. Toto vyšetření je u dospělého člověka
(či dítěte) relativně nenáročné, neboť stačí odebrat krev (viz výše). Komplikovanější je vyšetření
karyotypu
plodu, neboť buněčný materiál je potřeba získat pomocí některé z invazivních metod
prenatální diagnostiky (viz
Genetické poradenství). Toto vyšetření je zcela dobrovolné a vázané na
poučený souhlas.
Vyšetření karyotypu indikujeme u:
těhotných ţen, u který
ch je
zvýšené riziko vrozené vývojové vady
(v případě pozitivního
biochemického či ultrazvukového screeningu či pozitivní rodinné anamnézy)
těhotných
ţen nad 35 let
, u kterých je obecně zvýšené riziko
chromosomálních aberací
,
zvláště pak Downova syndromu (u této a předcházející moţnosti se samozřejmě provádí
vyšetření karyotypu plodu)
novorozenců a dětí, u kterých je důvodné
podezření na některou
chromosomální aberaci
.
dospívajících a dospělých, u kterých nacházíme
poruchy puberty či pohlavního vývoje
neplo
dných
párů, u kterých byly vyloučeny jiné příčiny neplodnosti, nebo u párů s
několika
spontánními potraty
zájemců o
dárcovství vajíček či spermií
4)
Geneticky podmíněné choroby
Monogenní genetické choroby jsou důsledkem
mutací, jejich ovlivnění vnějším prostředím bývá
minimální. Databáze
OMIM
(Online Mendelian inheritance in man), přístupná na
adrese
http://www.omim.org/
, obsahuje v současnosti přes 5000 popsaných monogenních chorob.
Samotná podstata genetických chorob
můţe být různá. V některých případech metabolických chorob
je na vině nedostatek enzymu, který katalyzuje určitou metabolickou dráhu (případ klasických
metabolických chorob jako jsou fenylketonurie nebo galaktosemie). V jiných případech můţe být na
vině porucha syntézy strukturní částice buňky (např. membránových kanálů u cystické fibrózy nebo
membránových receptorů u familiérní hypercholesterolemie) nebo je poškozena syntéza strukturního
proteinu, coţ se dotýká celých tkáňových systémů (osteogenesis imperfecta, svalové dystrofie). Často
lze následek deficitu produktu mutovaného genu odvodit logicky (mutace v genech pro syntézu
globinových řetězců způsobují příslušné hemoglobinopatie; nedostatek některých sráţecích faktorů
způsobuje hemofilii atd.).
Je třeba si uvědomit, ţe ne vţdy negativně působí deficit produktu, ale díky mutaci se můţe
syntetizovat pozměněný produkt, který můţe mít mnohem negativnější vliv, neţ jeho samotný
nedostatek. V potaz je také nutno brát všechny biochemické a fyziologické interakce, které se týkají
sledovaného produktu.
Choroby autozomálně recesivně dědičné
Fenylketonurie:
(PKU, Hyperfenylalaninémie, Föllingova nemoc, fenylketonurická oligofrenie)
Vrozená porucha metabolismu aminokyseliny fenylalaninu (nelze nasyntetizovat příslušný enzym
-
fenylalaninhydroxylasu), který nemůţe být přeměněn na tyrosin, a tudíţ jeho hladina v krvi stoupá a
odbourává se na jiné produkty (kyselina fenylmléčná, fenylpyrohroznová a fenyloctová). To vede k
poškozování CNS a následné mentální zaostalosti. U postiţených jedinců musí být dodrţována přísná
dieta, potom je onemocnění relativně bezproblémové. Neléčené onemocnění můţe CNS způsobit
těţké defekty. Existují i varianty způsobené deficitem jiných enzymů, nebo lehčí varianty s částečně
zachovanou enz
ymovou aktivitou. Matky i s lehčí formou onemocnění musí během těhotenství dietu
přísně dodrţovat, jinak hrozí poškození vývoje plodu. Výskyt onemocnění v populaci je asi 1 : 10000.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Galaktosemie:
Chybí enzym pro trávení galaktosy (často Galaktosa
-1-
fosfáturidyltransferasa), která
se hromadí v organismu a alternativní cestou se metabolizuje na galaktitol. Ten působí toxicky na
játra, mozek (vznik mentální retardace), ledviny a oční čočky a můţe vést k jejich poškození aţ
sle
potě. Neléčené onemocnění vede aţ ke smrti jedince. Galaktosa je mléčný cukr a proto musí být
nemoc u novorozenců rychle diagnostikována a jako terapie nasazena bezmléčná dieta.
Výskyt asi 1 : 60000.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Cystická fibrosa:
Vin
íkem choroby je mutace CFTR (Cystic fibrosis transmembrane conductance
regulator) genu, díky které je kódován vadný protein, a ten způsobí nefunkčnost membránových
iontových kanálů v postiţených buňkách. Jde o jedno z nejčastějších autozomálně recesivních
onemocnění člověka (asi 1 : 2500). Postihuje ţlázy s vnitřní sekrecí (pankreas, játra). V plicích se
navíc tvoří vazký hlen, vedoucí k respiračním potíţím. Sekundární infekce dýchacích cest můţe vést
aţ k váţnému poškození plic, i smrti. Ucpávání ţlučovodů
zase vede k poruchám trávení. U
postiţených ţen je plodnost sníţená, muţi bývají neplodní.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Leprechaunismus:
(Syndrom Donohue, Dysendokrinismus) Velmi vzácné onemocnění, poprvé
popsáno v roce 1954. Postiţení mají silné rty, velká ústa, vyhublý obličej s "groteskním" výrazem.
Dále byly popsány zvětšené pohlavní orgány, psychomotorická retardace a hyperinzulinemie. Většina
postiţených umírá v prvních měsících (aţ letech) ţivota.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Friedreichova ataxie:
Patří mezi onemocnění vyvolaná zmnoţením trinukleotidových repetic
(vyvolaná dynamickými mutacemi). Projevem je ataxie
-
poškozená je koordinace motorických
pohybů, sníţená je funkce šlachových a vřeténkových reflexů a některých částí sensitivity.
Ztíţená je i
řeč.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Choroby autozomálně dominantně dědičné
Familiární hypercholesterolemie:
Způsobena mutací genu, kódujícího membránový receptor pro
LDL (low density lipoproteins). LDL jsou skupina lipoproteinů, která transportuje většinu cholesterolu.
Při absenci membránových receptorů pro LDL dochází ke kumulaci LDL a cholesterolu v krevním
řečišti a poškozování cév. Postiţení jedinci mají mnohem vyšší riziko vzniku infarktu myokardu, neţ
zbytek populace. Většinu postiţených jedinců tvoří heterozygoti, homozygoti pro mutovanou alelu jsou
obzvláště těţce postiţeni.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
(neúplná dominance)
Syndaktylie, polydaktylie:
Srůst, respektive znásobení několika prstových článků. Onemocnění je
relativně
časté, ale dá se velmi dobře řešit chirurgickou cestou v raném věku.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
nebo dle příslušného asociovaného syndromu
Brachydaktylie:
Projevuje se krátkými, zavalitými prsty. Často téţ malý vzrůst + krátké ruce a nohy.
Rozsah
je velmi variabilní.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
nebo dle příslušného asociovaného syndromu
Arachnodaktylie:
Hlavním projevem jsou nepřirozeně dlouhé a tenké prsty. Taktéţ celé končetiny
mohou být abnormálně dlouhé a tenké. Vyskytuje se i jako součást různých syndromů (viz Marfanův
syndrom)
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
nebo dle příslušného asociovaného syndromu
Huntingtnova chorea:
Onemocnění je způsobeno zmnoţením CAG tripletů (vzniká dynamickou
mutací). Onemocnění se projevuje, pokud počet repetic přesáhne 40. Onemocnění má značně pozdní
nástup aţ mezi 35. a 45. rokem věku. Po nástupu choroby dochází k degenerativním změnám na
mozku, coţ se projevuje motorickými poruchami (neúčelné pohyby, chorea) a progresivní demencí.
Dochází k celkovým změnám osobnosti a postiţení umírají.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
, při mezigeneračním přenosu často dochází k dalšímu
zmnoţení repetic
Marfanův syndrom:
Mezi příznaky patří arachnodaktylie (dlouhé a tenké prsty), nadměrný vzrůst,
dlouhý a úzký obličej s
prominujícím nosem, dlouhé a tenké končetiny. Vyskytují se srdeční vady.
Délka ţivota bývá zkrácena, někdy se vyskytují náhlá úmrtí.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
Leidenská mutace:
(
Faktor V Leiden
) Dědičná trombofilie (zvýšená sráţlivost krve). Při delším
znehybnění mají trombofilici vysoké riziko tromboembolické choroby (TEN). V cévách se utváří tromby
(krevní sraţeniny), které se mohou utrhnout
-
vzniká embolus, který zapříčiní embolii a tím i smrt
postiţeného.
Nejvýznamnější mutací, způsobující dědičnou trombofilii, je tzv. "Leidenská mutace" (vzniká tzv. FVL
-
Faktor V Leiden, coţ je pozměněný faktor V hemokoagulační kaskády). Heterozygoti mají zvýšené
riziko vzniku tromboembolie, homozygoti jsou zatíţeni mnohem vyšším rizikem oproti běţné populac
i.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
Osteogenesis imperfecta:
Jde o dědičnou poruchu tvorbu kolagenu. Vyznačuje se vysokou
náchylností kostí k frakturám a deformitami kostry (skolióza, trojúhelníkovitá tvář). Přítomné mohou být
i vady kardiopulmonálního systému. Existuje několik různě závaţných typů této choroby.
Dědičnost
-
autozomálně dominantní
Choroby gonozomálně dědičné:
Gonozomálně dědičné choroby jsou vázány na gonozomech. V drtivé většině jde o choroby vázané
na
chromozomu X
. Proto také někdy gonozomální dědičnost označujeme jako dědičnost
X-
vázanou
.
Gonozomálně recesivní choroby postihují většinou muţe. Ţeny bývají častěji přenašečky a jen zřídka
jsou samy postiţeny (recesivní homozygotky). Vzhledem k tomu, ţe u ţeny je v kaţdé buňce jeden z
X chro
mozomů inaktivován (a to zcela náhodně, bez ohledu na to, zda nese mutovanou alelu nebo
ne), mohou i heterozygotky vykazovat určité příznaky onemocnění, s ohledem na to, kolik buněk
obsahuje inaktivovaný X chromozom se zdravou alelou.
Gonozomálně dominantní choroby postihují obě pohlaví, postiţený otec však nikdy nepředá nemoc
svému synovi, zatímco všechny jeho dcery budou postiţeny (samozřejmě uvaţujeme X
-
vázanou
dědičnost).
Hemofilie:
Hemofilie je vrozená nesráţlivost krve. Rozlišuje se hemofilie A, podmíněná dysfunkcí
sráţlivého faktoru VIII (jeden z faktorů hemokoagulační kaskády, která je zodpovědná za sráţení krve)
a hemofilie B, způsobená nedostatkem faktoru IX. Klinicky jsou oba typy stejné, projevují se
krvácením do měkkých tkání, svalů i kloubů.
Dědičnost
-
gonozomálně recesivní
Daltonismus:
Jedna z vrozených příčin barvosleposti. U postiţených chybí, nebo je omezena
schopnost rozlišit červenou a zelenou barvu.
Dědičnost
-
gonozomálně recesivní
Svalové dystrofie:
Duchennova (DMD) a Beckerova (BMD) s
valová (muskulární) dystrofie jsou X
-
vázané poruchy syntézy dystrofinu, coţ je jeden ze strukturních proteinů svalových tkání. U
postiţených se v raném dětství začne projevovat svalová slabost, která začíná progresivně omezovat
motoriku jedince. Charakteri
stickým projevem jsou hypertrofická lýtka.
Duchennova svalová dystrofie
má závaţnější prognózu; úbytek hybnosti je rychlý a postiţení
umírají okolo 20. roku ţivota na srdeční nebo respirační selhání.
Beckerova svalová dystrofie
má mírnější a více variabilní průběh.
Dědičnost
-
gonozomálně recesivní
Syndrom fragilního X chromozomu:
Jde o jednu z nejčastějších příčin vrozené mentální retardace
(po Downově syndromu). Jak název napovídá, je příčina nemoci spojena s fragilním místem na X
chromozomu (Xq27). U jed
inců s tímto syndromem nacházíme v těchto místech zmnoţení
trinukleotidových repetic, přičemţ 200 repetic se povaţuje za hraniční limit pro manifestaci
onemocnění. Kromě středně těţké mentální retardace patří k projevům onemocnění i hyperaktivita,
charakte
ristický vzhled (protaţený obličej, zvětšené ušní boltce, prominující brada, zvětšená varlata).
Onemocnění postihuje především chlapce, mírnou mentální retardaci mohou vykazovat i některé ţeny
-
přenašečky.
Dědičnost
-
gonozomálně recesivní
Vitamin D rezis
tentní rachitis:
Jde o jeden z typů křivice, která je rezistentní vůči léčbě vitamínem D.
Jedna z menšího mnoţství gonozomálně dominantních chorob. Projevem je klasická křivice s
moţnými dalšími kostními deformitami.
Dědičnost
-
gonozomálně dominantní
Glob
inová onemocnění:
Hemoglobin je červené krevní barvivo, schopné vázat (prostřednictvím atomu dvojmocného ţeleza)
kyslík. Skládá se z prostetické skupiny hemu a proteinové sloţky
-
globinu. Rozlišuje se několik typů
hemoglobinů, obecně embryonální, fetální a dospělé typy, které se liší jednotlivým zastoupením
globinových řetězců a afinitou ke kyslíku. Hemoglobin A (HbA), který tvoří naprostou většinu
hemoglobinu u dospělých jedinců, se skládá ze dvou řetězců α a dvou řetězců β.
Srpková anemie:
(Sickle cell a
nemia) Těţká, dědičná forma hemolytické anemie. Příčinou je bodová
mutace v β globinovém řetězci, díky které se syntetizuje pozměněný produkt (hemoglobin se označuje
jako HbS). Erytrocyty pacientů se za určitých podmínek zkroutí do srpkovité podoby. Dochází k
ucpávání kapilár a zvětšení sleziny, která má sníţenou funkci. Onemocnění je recesivně dědičné,
heterozygoti jsou zdraví, pouze za výjimečných okolností se u nich mohou objevit nějaké potíţe.
Heterozygoti jsou mnohem odolnější proti malárii, neţ zdraví
jedinci; v oblasti výskytu malárie tvoří
heterozygoti aţ polovinu populace.
Dědičnost
-
autozomálně recesivní
Thalasémie:
Jedny z nejobvyklejších monogenních chorob světa, časté především ve středomoří.
Rozlišuje se
alfa-thalasemie
a
beta-thalasemie
, podl
e toho, který řetězec hemoglobinu má
poškozenou syntézu. Druhý řetězec se syntetizuje v normálním mnoţství, vzhledem k situaci je však v
relativním nadbytku. Zatímco alfa řetězec je kódován v genomu 4 alelami, pro beta řetězec jsou k
dispozici pouze alely
2. Proto můţe mít thalasemie variabilní rozsah postiţení, v závislosti na tom,
kolik alel kterého řetězce je mutováno. Projevem je různě těţká hemolytická anémie.
Dědičnost
-
Dostları ilə paylaş: |