Maxam & Gilbertova
metoda se vyhodnocuje podobným způsobem (elektroforeticky), ovšem reakce,
při které vznikají různě dlouhé oligonukleotidy, nevyuţívá polymerace podle vzorového vlákna, ale
specifického chemického štěpení DNA za určitými nukleotidy.
Výsledky mapování
Výsledky zkoumání genomu jsou různé (výsledky nejznámějšího projektu
-
přečtení lidského genomu
-
najdete v kapitole
Genetika člověka). Existují genové mapy, které jsou vytvořeny na základě výpočtů,
vycházejících ze zákonů genové vazby (vzdálenosti v centiMorganech
-
cM). Existují také fyzické
mapy, zaloţené na přesné pozici genu v sekvenci DNA (vzdálenosti v párech bází
- pb). Znalost
kompletní sekvence genomu je nesmírně uţitečná, sama však pro přesnou lokalizaci všech genů
nestačí. Velké mnoţství genů (přesněji jejich mutovaných forem) bylo objeveno aţ jako původci
různých dědičných onemocnění. I obecně platí, ţe nejlépe funkci genu poznáme, kdyţ mutací tento
gen vyřadíme z funkce.
Vzhledem k tomu, ţe z etických důvodů nelze provádět cílenou mutagenezi a některé další pokusy na
člověku, jsou pro další výzkum lidského genomu nedocenitelné výsledky získané u jiných organismů,
které jsou potom porovnávány s dosavadními výsledky výzkumu u člověka (komparativní genomika).
3)
Genová terapie
Moţnosti genové terapie
Geneticky podmíněné choroby
jsou stále velkým problémem moderní lékařské vědy. U velkého
mnoţství z nich jiţ známe příčinu (tedy mutaci konkrétního genu
-
genů), ovšem tuto příčinu nejsme v
současné době schopni vyléčit
-
neexistence kauzální terapie
. Současná medicína nabízí mnoho
moţností symptomatické léčby, kdy se snaţíme různými způsoby zlepšit průběh nemoci. Tato léčba
však neléčí samotnou podstatu choroby a tak je pacient na této léčbě často závislý po celý ţivot.
Symptomatická léčba zahrnuje:
Dodání chybějícího enzymu u enzymopatií
Dodání jiných chybějících látek (substrátů, proteinů...)
Vyvar
ování se substrátu, který nelze správně metabolizovat (speciální diety)
Chirurgické zákroky
Farmakologické ovlivnění narušených fyziologických procesů
Farmakologické zlepšení kvality ţivota
Jiné ovlivnění fyziologických procesů nebo kvality ţivota (přístroje, pomůcky)
Transplantace chorobou poškozeného orgánu
Během posledních let dochází k prudkému rozvoji molekulární biologie. Na přečtení lidského genomu
navazují pokroky v proteomice a farmakogenomice. Nové znalosti nám umoţňují nejen zlepšovat
stávající léčebné postupy, ale dávají i naději do budoucna, kdy snad budeme schopni léčit přímo
příčinu dědičných onemocnění. Genová terapie bude v budoucnosti moţná léčit i většinu nádorových
onemocnění.
Genová terapie
znamená vpravení genetické informace do buněk za účelem léčebného účinku.
Ačkoliv u některých pacientů byla jiţ genová terapie úspěšně pouţita (jako první se pomocí genové
terapie léčily určité typy těţkých imunodeficitů), stále se jedná spíše o experimentální terapii, která s
sebou můţe nést řadu vedlejších efektů. Co vlastně musí být splněno, abychom mohli zahájit genovou
terapii?
1)
Musíme znát přesnou příčinu genetické choroby. Tedy musíme znát přesný gen(y), jeho
umístění, povahu produktu a hlavně mechanizmus
patologického účinku
. Patologicky totiţ
můţe působit jak deficit normálního genového produktu, tak i pozměněný produkt mutovaného
genu. Samozřejmostí je znalost přesné sekvence zdravého genu. Pro současnou
experimentální genovou terapii jsou vybírány choroby, pro které jiná léčba neexistuje a které
mají velmi těţký, často letální průběh.
2)
S ohledem na výše uvedené poţadavky musíme mít správně vytvořenou strategii genové
terapie. Pokud je patologický nedostatek genového produktu, potom stačí dodatečné zařazení
nemutovaného genu kamkoliv do genomu příslušných buněk. Pokud však patologicky působí
pozměněný produkt mutovaného genu, potom je nutné buď
opravit mutovaný gen
(to by
byla pravá kauzální terapie
-
odstranění příčiny) nebo zablokování tohoto genu (odstranění
genu, zamezení transkripce...). S tím souvisí i zajištění fyziologické aktivity tohoto genu
(posílení, nebo utlumení transkripce, je
-
li potřeba).
3)
Součástí strategie je i volba vhodného vektoru (nosiče) a vytipování cílových buněk genové
terapie.
4)
S ohledem na jistou kontroverznost této terapie je třeba provádět genovou terapii pouze
pokud je úspěšně otestována a schválena k pouţití. K podstoupení experimentální terapie je
vţdy potřeba souhlas pacienta (či jeho zákonného zástupce). Pro uţití genové terapie budou v
budoucnosti pravděpodobně přijaty zákonné i podzákonné normy.
Samotné provedení genové terapie zahrnuje:
1)
Vytvoření genetické informace (metodami
rekombinantní DNA), která je určená pro transport
do buněk.
2)
Vytipování buněk, do kterých bude upravená genetická informace vnesena. Genová tera
pie
se můţe provádět jak
in vivo
(kdy jsou cílové buňky po celou dobu součástí organismu), tak
in
vitro
(kdy jsou cílové buňky z těla organismu nejprve odebrány a po provedení genové terapie
opět vráceny na své místo v organismu).
3)
Výběr vhodného vektoru (nosiče), který bude pouţit pro vpravení genetické informace do
cílových buněk. Moţností je mnoho
-
např. mechanické metody (mikrojehly), chemické či
fyzikální metody (specifickým způsobem umoţní průnik gen. informace cytoplazmatickou
membránou), samotná DNA
či DNA v komplexech s různými molekulami. V současnosti se
však nejvíce vyuţívá
virových vektorů
(jde zejména o adenoviry a retroviry, které mají
schopnost inzerce své gen. informace do genomu hostitelské buňky). Do virových kapsid je
zabudována terapeutická gen. informace (virová gen. inf. je odstraněna) a virové vektory jsou
aplikovány.
4)
Po provedení genové terapie je třeba pacientův stav pečlivě monitorovat a všímat si jak
zlepšování zdravotního stavu, tak i nástupu případných komplikací.
Nevýhody genové terapie
Výhody genové terapie se zdají být nesporné. Existují však i stinné stránky této metody (odvolávám se
na současný stav; je snaha tyto negativa zmírnit či eliminovat). Je to například:
Velmi vysoká finanční náročnost takovéto terapie.
Technická a technologická náročnost.
Nízká úspěšnost terapie, pokud jsou problémy s "uchycením" vnášené genetické informace.
Při pouţití virových vektorů je genetická informace do genomu vloţena víceméně náhodně.
Vnesený gen tak můţe narušit sekvenci jiného genu (narušení protoonkogenu nebo tumor
-
supresorového genu můţe spustit maligní transformaci buňky).
Genová terapie je eticky problematická.
V budoucnosti by genová terapie mohla nejen zachraňovat ţivoty pacientům s těţkými genetickými
chorobami či rakovinou, ale mohla by zpříjemnit ţivot i mnoha dalším lidem, jejichţ choroba sice není
natolik závaţná, ale stejně jsou odkázáni na podpůrnou terapii. Bude však potřeba přesně vymezit
hranici mezi tím, na co je ještě etické genovou terapii pouţít a na co uţ ne. Budou v budoucnosti "děti
na objednávku"? Budeme si moc určit barvu očí, vlasů či výšku našich dětí? Pokud budeme umět
vytvářet děti bez genetických chorob
-
nemohly by tyto děti být také fyzicky zdatnější? Dočkáme se éry
superlidí?
Odpověď nám dá aţ budoucnost. Dle mého názoru se však nesmíme dočkat doby, kdy by se z
genové terapie stal takový obchod, jakým je dnes třeba plastická chirurgie. Vylepšení genomu na
objednávku a jen pro majetné by bylo vyloţené pošlapání současných nadějí.
11.
Slovníček
A
Adenin
6-amin
opurin; purinová báze, přítomná v DNA i RNA
AIDS
Acquired immunodeficiency syndrome -
syndrom získané imunodeficience, způsobený virem
HIV (Human immunodeficiency virus)
Alela
Konkrétní forma genu, vyskytující se ve specifickém lokusu
AMC
viz Amniocentéza
Amniocentéza
Invazivní zákrok vyuţívaný k získání plodové vody a buněk k cytogenetickému vyšetření plodu
Anafáze
Fáze buněčného dělení, při které dochází k rozestupu chromosomů k pólům buňky
Apoptóza
Programovaná buněčná smrt; na rozdíl od nekrózy nepoškozuje okolní buňky
Arabidopsis thaliana
Huseníček rolní
-
rostlina z čeledi brukvovitých; modelový organismus genetického výzkumu
Autosomy
Somatické chromosomy
-
všechny chromosomy mimo chromosomy pohlavní
B
B generace
Generace zpětného kříţení (backcross)
- mezi jedincem F generace a P generace
Bakteriofág
Virus napadající bakterie
Barrovo tělísko
Optickým mikroskopem pozorovatelná "hrudka" chromatinu, která představuje inaktivovaný X
chromosom (vyskytuje se u jedinců s více neţ jedním X chromosomem
-
běţně tedy u ţen)
Bivalent
Sdruţený pár homologních zdvojených chromosomů pozorovatelný během meiotické profáze;
někdy téţ nazývaný tetráda
C
cDNA
Complementary DNA -
DNA vzniklá zpětným přepisem z RNA do DNA; vyuţívaná v cDNA
knihovnách
Caenorhabdis elegans
Mal
á hlístice slouţící jako modelový organismus genetického výzkumu
Centromera
Místo primárního zaškrcení chromosomu, odděluje krátké a dlouhé raménko
Crossing-over
Proces rekombinace mezi homologními chromosomy během profáze meiotického dělení
CVS
Chorionic villus sampling -
viz odběr choriových klků
Cytosin
2-oxo-4-
aminopyrimidin; pyrimidinová báze, přítomná v DNA i RNA
D
Denaturace
Proces, při kterém se dvoušroubovice DNA (vlivem teploty nebo iontů solí) rozpojí na
jednotlivá vlákna (zrušení vodíkových můstků)
DGGE
Denaturing gradient gel electrophoresis -
jedna z metod přímé DNA diagnostiky, vyuţívající
elektroforézu na gelu s denaturačním činidlem
Dihydrouridin
Jedna z minoritních bazí, přítomná v D kličce tRNA
Diktyotene
Stádium klidu nedokončené meiotické profáze, ve kterém se lidský oocyt nachází aţ do
případné ovulace
Diplotene
4. fáze profáze I. meiotického dělení
Disjunkce
Proces rozchodu chromosomů k opačným pólům buňky během buněčného dělení
Disrupce
Porucha prenatálního vývoje, způsobená negativním
mechanickým vlivem vnějšího prostředí
na normálně se vyvíjející orgán
DNA
Kyselina deoxyribonukleová
Drosophila melanogaster
Octomilka -
malá muška slouţící jako modelový organismus genetického výzkumu
Dysplasie
Porucha prenatálního vývoje jedince, způsobená abnormálním uspořádáváním buněk ve
vyvíjejícím se orgánu
E
Enzymy
Biokatalyzátory
-
je jim věnována kapitola
Enzymy
Eufenika
Zlepšování fenotypu postiţených jedinců
Eugenika
Zlepšování genofondu populace sniţováním frekvence neţádoucích alel
Euchromatin
Dekondenzovaný chromatin (je zde transkripční aktivita), jevící se světle v optickém
mikroskopu
Exon
Oblast genu přepisovaná do RNA, která obsahuje sekvence skutečně kódující proteiny
F
F1 generace
Filiální generace
-
vzniká kříţením P generací; kříţením
F1 jedinců vznikají F2 jedinci atd.
Fenotyp
Soubor všech dědičných znaků jedince; více či méně pozorovatelný projev genotypu
Fetus
Plod; u člověka je jako plod označován vyvíjející se jedinec starší 3 měsíců
FISH
Fluorescent in situ hybridization - fluore
scenční in situ hybridizace
-
metoda přímé detekce
specifického úseku genomu pomocí fluorescenčně značené sondy
G
Gameta
Pohlavní buňka s haploidní sadou chromosomů; splynutím samčí a samičí gamety vzniká
zygota
Gen
Specificky umístěná jednotka dědičné informace, kódující sekvenci pro tvorbu proteinového
produktu
Genofond
Soubor všech genů v populaci určitého druhu
Genom
Soubor veškeré dědičné informace buňky nebo jedince
Genomika
Oblast genetiky, zabývající se genomem určitého organismu; úkolem bývá sekven
ovat genom
organismu a vyuţívat tyto informace v dalších oblastech genomiky (proteomika,
farmakogenomika, nutrigenomika...)
Genotyp
Genetická výbava jedince; podmiňuje fenotyp
Gonosomy
Pohlavní chromosomy; nejsou homologní; jejich kombinace v buňce podmiňuje pohlaví
jedince
Guanin
2-amino-6-
oxopurin; purinová báze, přítomná v DNA i RNA
H
HA
Heteroduplex analysis -
heteroduplexová analýza; metoda přímé DNA diagnostiky, zaloţená
na tvorbě heteroduplexů mutovaného a nemutovaného vlákna
Haplotyp
Skupina alel na
jednom chromosomu, které jsou děděny spolu (nedochází mezi nimi k
rekombinaci)
Hemizygot
Jedinec pouze s jednou alelou sledovaného genu; typické pro muţe vzhledem ke genům
umístěným na X chromosomu
Heterochromatin
Kondenzovaný chromatin (neprobíhá zde transkripce), jevící se tmavě v optickém mikroskopu
Heterozygot
Jedinec, jehoţ alely sledovaného genu jsou navzájem různé
Histony
Bazické proteiny, spoluvytvářející stavbu chromatinu a celých eukaryotických chromosomů
HLP
Histon like proteins -
histonům podobné proteiny
-
prokaryotické proteiny, které zastávají u
prokaryot podobnou funkci jako histony u eukaryot
Homeoboxové geny
Geny s vysoce konzervovanou doménou (homeodoménou), která se relativně nezměněná
vyskytuje u většiny organismů; HOX geny jsou významné morfogeny, určující ontogenetický
vývoj jedince
Homozygot
Jedinec, jehoţ alely sledovaného genu jsou stejné
HUGO
Human Genome Organisation -
organizace pro mapování lidského genomu
-
http://www.hugo-
international.org/
Hybridizace
Proces spojování dvou komplementárních vláken DNA podle pravidel o párování bází; takto
můţe například hybridizovat specifická sonda s vyšetřovaným vláknem DNA
Ch
Chiasmata
Překříţení, viditelná během meiotické profáze v místech, kde došlo ke crossing
-overu
Chloroplast
Semiautonomní organela rostlin, schopná fotosyntézy; obsahuje vlastní genetickou informaci
Chromosom
Pentlicovitý útvar tvořený DNA a bílkovinami, nejlépe viditelný v kondenzovaném stavu během
mitózy nebo meiózy eukaryotických buněk
I
Inbreeding
Kříţení příbuzných jedinců
Imprinting
Specifické označování určitých sekvencí DNA pomocí methylace bází; díky tomuto fenoménu
lze odlišovat, zda je takto označený chromosom mateřského nebo otcovského původu
Inosin
Nukleotid, o
bsahující deaminovaný adenin
- hypoxanthin (6-
oxypurin); vyskytuje se v menším
mnoţství v tRNA
Intron
Oblast genu přepisovaná do RNA, která neobsahuje sekvence skutečně kódující proteiny; je
vyštěpena během posttranskripčních úprav u eukaryot
ISH
In situ hybridization -
in situ hybridizace; metoda detekce specifické sekvence pomocí
značené sondy in situ (třeba na podloţním sklíčku)
IVF
In vitro fertilization -
oplodnění ve zkumavce
K
Kancerogen
Látka schopná vyvolat nádorové bujení
Karyotyp
Chromosomální výbava buňky nebo jedince
Kinetochora
Úsek na centromeře, do kterého se upínají mikrotubuly dělícího vřeténka během mitózy či
meiózy
Kolchicin
Původem rostlinný alkaloid, pouţívaný v cytogenetice jako "vřeténkový jed", schopný zadrţet
buňku v metafázi mitotického dělení (za účelem snadnějšího pozorování chromosomů)
L
Leptotene
1. fáze profáze I. meiotického dělení
Lokus
Místo (pozice) určitého genu na chromosomu
M
Malformace
Porucha prenatálního vývoje jedince, postihující zpravidla pouze jeden orgán; bývá
po
dmíněna geneticky
Meióza
Redukční dělení (ve skutečnosti pouze I. meiotické dělení je redukční; II. meiotické dělení je
stejně jako mitóza dělení ekvační); díky němu vznikají haploidní buňky (gamety)
Metafáze
Fáze buněčného dělení, během které se chromosomy staví do středové (ekvatoriální) roviny
Mitochondrie
Semiautonomní organela eukaryotických buněk; obsahuje vlastní genetickou informaci a
slouţí jako energetické centrum buňky
Mitóza
Ekvační dělení; vznikají jím buňky se shodnou chromosomální výbavou (diploidní)
mRNA
Messenger RNA -
mediátorová RNA; slouţí jako matrice pro proteosyntézu
mtDNA
Mitochondriální DNA
-
genetická informace, uchovávaná v kruhové molekule DNA
mitochondrií
Mus musculus
Myš domácí
-
modelový organismus vyuţívaný v genetickém výzkum
u
Mutace
Změna v sekvenci DNA; pokud neznemoţňuje rozmnoţování jedince, pak je dědičná
Mutagen
Faktor vnějšího prostředí, schopný zapříčinit mutace v genetické informaci organismu
N
Nekróza
Neprogramovaná buněčná smrt, způsobená virovou nebo bakteriální infekcí, nebo jinými
nepříznivými vnějšími vlivy; enzymy z rozpadlé buňky mohou poškozovat buňky okolní
Nondisjunkce
Proces chybného rozestupu chromosmů při mitóze nebo meióze
Nukleoid
Jaderný ekvivalent
-
prokaryotické "jádro" tvořené především jedinou cirkulární molekulou
DNA
Nukleolus
Jadérko je součást eukaryotického jádra, tvořená především RNA a proteiny, odpovědná za
syntézu ribozomální RNA
Nukleosom
Základní struktura chromatinu, tvořená osmi histony, obtočenými DNA o délce 143 párů bází
Nukleus
Jádro; buněčná organela obsahující naprostou většinu buněčné genetické informace
O
Odběr choriových klků
Invazivní metoda slouţící k získání buněk s genetickou informací plodu z choriových klků. Je
zatíţena vyšším rizikem neţ amniocentéza, ale buňky se rychleji
kultivují.
Onkogeny
Geny, jejichţ mutace způsobí neřízené dělení buňky a stává se tak základem pro nádorové
bujení; jediná funkční kopie onkogenu nestačí udrţet buněčnou regulaci v normálu
Oocyt
Vajíčko; ţenská gameta
Operon
Prokaryotická transkripční jednotka, kódující více proteinů najednou
P
P generace
Parentální generace
-
rodičovská generace
Pachytene
3. fáze profáze I. meiotického dělení
PCR
Polymerase chain reaction -
polymerázová řetězová reakce; cyklická reakce, která umoţňuje
mnohonásobné namnoţení poţadovaného úseku DNA
PKU
Fenylketonurie -
dědičná metabolická choroba způsobená deficiencí enzymu
fenylalaninhydroxylasy
Polymorfismus
Pokud se v daném lokusu mohou v populaci vyskytovat minimálně dvě různé alely, z nichţ
vzácnější alela se objevuje alespoň v 1% případů, potom je tento gen polymorfní
pre-mRNA
Primární eukaryotická mRNA, která ještě neprošla postranskripčními úpravami
Profáze
První fáze buněčného dělení (u meiotického dělení se ještě rozděluje na další fáze), při které
se chromosomy kon
denzují a spiralizují
Prometafáze
Přechod buněčného dělení z profáze do metafáze, charakterizovaný rozpadem jaderného
obalu
Promotor
Signální sekvence v DNA, která je důleţitá pro nasednutí příslušné RNA
-
polymerasy a tím
pádem pro rozeznání začátku transkr
ipce
Proband
Jedinec, na jehoţ ţádost je sestavováno genealogické schéma
Pseudouridin
Minoritní báze, přítomná v ψ kličce tRNA
R
Rattus norvegicus
Potkan -
modelový organismus slouţící v genetickém výzkumu
Renaturace
Opětovná asociace denaturovaných vláken
dvoušroubovice DNA (opětovná tvorba
vodíkových můstků mezi vzájemně komplementárními úseky)
Retrovirus
Skupina RNA virů, schopné pomocí reverzní transkriptázy přepsat svou genetickou informaci
do DNA, kterou následně mohou inzertovat do genomu hostitelské
buňky
Dostları ilə paylaş: |