Nesmyslné mutace
(nonsense mutation), které zapříčiní vznik předčasného terminačního
k
odonu v sekvenci DNA. Syntéza takového polypeptidu paki není dokončena a výsledkem je
zcela nefunkční protein. Tyto mutace jsou způsobeny delecí nebo inzercí určitého mnoţství
bází, pokud nejde o 3n násobek.
Dynamické mutace
Dynamické mutace jsou speciálním typem mutací. Jsou spojené s fenoménem
expanze repetitivních
sekvencí
(typicky jde o expanzi
trinukleotidových repetic). Bylo zjištěno, ţe u některých chorob
(
Huntingtonova chorea
,
syndrom fragilního X chromozomu
,
myotonická
dystrofie
či
Friedrichova ataxie
) nalézáme oproti normálu zvýšený počet trinukleotidových repetich
(existují i dinukleotidové a jiné repetice) na specifickém úseku genomu. Vinou
nepřesností při
replikaci
tohoto úseku, můţe docházet ke
zvyšování
počtu trinukleotidovýc repetic. V rámci jedné
rodiny se tak můţe počet repetic z generace na generaci zvyšovat.Pokud nepřesáhne počet repetic
kritické číslo (k rozvoji choroby), ale je oproti normálu zvýšen, označuje se tento stav jako
premutace
.
Jakmile je tento kritický počet dosaţen či překročen, dojde k
plné mutaci
a u jedince se manifestuje
příslušná choroba.
Pokud k nondisjunkci dojde při meiotickém dělení (při I. nebo II. meiotickém dělení) během vzniku
pohlavních buněk (nondisjunkce na germinální úrovni), potom bude mít zygota k jejímuţ v
zniku
přispěla tato aberovaná gameta nestandardní počet chromosomů a tím pádem kaţdá buňka jedince,
který z této zygoty vznikne (tedy pokud vůbec bude vývoj dále pokračovat...), bude mít aberovaný
karyotyp. Pokud k dojde k nondisjunkci aţ během mitózy
- vz
niká chromosomová mozaika
-
viz níţe.
Somatické a gametické mutace
Somatické mutace
jsou mutace, které postihují somatické ("tělové")
-
tedy nepohlavní buňky
organizmu v průběhu jeho ţivota. Mutace v těchto buňkách vedou k lokálnímu postiţení
-
poškozené
b
uňky hynou apoptózou či nekrózou, případně mutace mohou nastartovat proces maligní
transformace, který povede ke vzniku nádorového onemocnění. Důleţité je, ţe mutace v somatických
buňkách se
nepřenáší na další generace
.
Gametické mutace
jsou mutace vzniklé
v gametách
-
pohlavních buňkách organizmu. Nebezpečí
těchto mutací spočívá v tom, ţe jakmile dojde s pomocí mutované gamety k oplození a ke vzniku
zygoty -
bude se příslušná mutace následně i v této zygotě nacházet.
Jelikoţ ze zygoty vznikají v
průběhu vývoje všechny buňky těla
(somatické buňky i gamety)
-
bude se příslušná mutac
e
nacházet
ve všech buňkách organizmu
coţ se typicky projevuje fenotypem příslušné gentické
choroby a navíc se tato mutace můţe
přenášet do dalších generací
.
Význam mutací
Z hledis
ka klinické genetiky, jsou to právě mutace, které způsobují
genetické choroby, vývojové vady
nebo nádorové bujení. Ovšem vzhledem k tomu, ţe jen malá část lidského genomu (asi 1,5 %)
skutečně kóduje proteiny, dochází k většině mutací v nekódujících oblastech. I zde však mohou
mutace působit negativně, pokud změní sekvenci promotoru, regulační oblasti transkripce nebo
signální sekvenci pro sestřih pre
-
mRNA. Závaţnější projev mají mutace v kódujících oblastech.
Z pohledu
evoluce
jsou mutace velmi
uţitečné
. Dříve byly dokonce povaţovány za hybnou sílu
evoluce, dnes jim jiţ tak obrovský význam přiznáván není. Mutace mohou být z evolučního hlediska
nevýhodné, neutrální nebo výhodné. Největší šanci udrţet se a následně zasáhnout do evoluce mají
mutace výhodné, ani
ty se však nemusí udrţet a mohou být z
genofondu
vyeliminovány.
8)
Mutageny
Mutageny
jsou faktory, které jsou schopny způsobovat
mutace
, tedy měnit genetickou informaci
organizmu. Mutageny jsou předmětem i nástrojem genetického výzkumu. Mutace můţeme i uměle
indukovat, coţ se vyuţívá k pokusům na modelových organismech, zejména pro studiem exprese
genů. Experimentálně se také testují potencionální mutagenní účinky nových chemických látek. Z
pohledu klinického genetika jde pak především o neţádoucí faktory vnějšího prostředí, které mohou
poškodit genetickou informaci člověka.
Rozdělení mutagenů
Mutageny jsou faktory různé povahy. Obecně se proto rozdělují do tří hlavních skupin:
Fyzikální mutageny
UV záření
-
zdrojem je Slunce, nebezpečné je zejména vzhledem ke
slábnoucí
ozonové vrstvě
Ionizující záření
-
radioaktivní nebo RTG záření. Můţe způsobovat chromozomové
zlomy (mutageny způsobující chromozomální zlomy se obecně označují
jako
klastogeny
).
Chemické
Aromatické uhlovodíky
-
v tabákovém kouři a produktech spalování vůbec
Barviva -
např. akridinová barviva
Organická rozpouštědla
Některé dříve běţně uţívané látky
-
např. součásti plastů (PCB), hnojiv, herbicidů,
insekticidů (DDT) nebo i léčiv
Bojové látky
-
např. yperit
Biologické
Viry -
některé viry (retroviry) se mohou inkorporovat do genetické informace
infikované buňky, čímţ mohou porušit sekvenci některého strukturního genu, nebo
jeho regulační oblasti, promotor aj.
Mobilní genomové sekvence
- transpozony a retrotranspozony -
mohou působit
stejným mechanism
em jako retroviry -
tj. inzercí na "nesprávné" místo v genomu.
Další dělení mutagenů rozlišuje, zda mutagenně působí samotný mutagen, nebo zda působí
zprostředkovaně.
Přímé mutageny
-
působí mutagenně přímo.
Nepřímé mutageny
-
nepůsobí mutagenně přímo, nejprve musí být v buňce přeměněny na
vlastní mutagenní formu, nebo vedou ke vzniku faktorů, které jiţ jsou samy o sobě mutagenní.
Mutageny a klinická genetika
Působení mutagenů na lidského jedince se můţe projevit několika různými způsoby.
U dospělého člověka mohou některé mutageny působit jako
karcinogeny
a způsobit tak
zhoubné bujení (rakovinu). Principem nádorové transformace je vznik mutací v somatických
(tělních) buňkách.
Pokud mutageny způsobí mutace v pohlavních buňkách (gametách), dojde ke vzniku mut
ace,
která se u příslušné osoby neprojeví, ale projeví se u potomka, který z gamety s příslušnou
mutací vznikne. Takovéto případy "
nové mutace
" (ani jeden z rodičů příslušnou genetickou
chorobu nemá) jsou relativně častou příčinou vzniku různých monogenních chorob (například
achondroplázie).
Některé mutageny mohou mít účinkovat i jako
teratogeny
-
tedy způsobovat poruchy
prenatálního vývoje jedince (čímţ vznikají
vývojové vady
).
Ne kaţdá látka (či faktor) s mutagenním účinkem se ovšem zároveň uplatňuje jako
karcinogen nebo
teratogen. Naopak -
ne kaţdý teratogen či karcinogen musí být zároveň i mutagen. Proto nelze tyto tři
pojmy v ţádném případě povaţovat za synonyma.
Testování genotoxicity
Pro ověřování genotoxických (mutagenních) účinků různých vnějších faktorů existuje skupina
specializovaných testů. Ověřuje se jak mutagenní potenciál samotných látek (např. chemikálií) –
in
vitro
, tak i současný stav jedince po expozici mutagenům –
testy in vivo.
Amesův test
je klasickým testem pro stanovení mutagenního potenciálu různých chemikálií. Původní
provedení tohoto testu počítá se speciálním kmenem bakterie
Salmonella typhimurium
, který má
mutovaný gen, jeţ bakterii umoţňuje syntetizovat aminokyselinu histidin. Jelikoţ bakterie roste na
ţivné půdě, která tuto aminokyselinu neobsahuje, nemá bakterie k této aminokyselině přístup a
nepřeţívá. Test probíhá tak, ţe tento kmen bakterie je vystaven působení zkoumané látky. Poté je
sledován růst těchto kolonií na oné ţivné půdě bez histidinu. Procento přeţívajících kolonií
ukazuje na
mutagenní potenciál zkoumané látky –
nastane totiţ "mutace mutace" –
tedy zpětná mutace, kdy
vlastně dojde k opravě původně defektního genu, čímţ bakterie získá opět schopnost syntetizovat
histidin (a přeţít).
Test ZCHA (ZCA)
, neboli Z
ískaných
Ch
romozomálních
A
berací nám umoţňuje zhodnotit vliv
mutagenů na struktury in vivo. Provedení testu je velmi jednoduché. Po odběru periferní krve a
kultivaci získaných lymfocytů hodnotíme procento aberantních buněk, tj. buněk s chromozomální
aberací. Tato metoda informuje o expozici vyšetřovaného jedince mutagenům v průběhu několika
posledních měsíců. Hodnoty (přibliţně) do 3
% jsou normální, mezi 3
% a 5
% hraniční a nad 5
%
vysoké. Toto vyšetření se můţe provádět například i v rámci preventivních prohlídek
zaměstnanců
pracujících v prostředí s vyšším rizikem genotoxicity.
Další příklady genotoxických testů naleznete v kapitole
genetické testy
.
5.
Základy dědičnosti
1)
Geny a dědičné znaky
Gen je specificky uloţená jednotka dědičné informace. Z molekulárního hlediska jde o úsek nukleové
kyseliny se specifickým pořadím nukleotidů, které podmiňuje strukturu a funkci genového produktu. Do
jeho struktury patří i regulační sekvence, jako je promotor nebo terminátor, které jsou rozeznávány
polymerázami a umoţňují tak správné a ohraničené zpracování dědičné informace nesené konkrétním
genem (více v sekci
molekulární genetika
).
Jako
pseudogen
označujeme "mrtvý" gen, který není aktivní a jehoţ informace není realizována
(důvodem inaktivity jsou většinou nefunkční nebo chybějící regulační sekvence).
Geny můţeme rozdělit podle jejich účinnosti při realizaci dědičného znaku.
a) Monogenní
Geny velkého účinku, na tvorbě znaku se podílí málo genů (často jen jeden), většinou
jde o znak kvalitativní. Jsou rozhodující pro monogenní typ dědičnosti.
b) Polygenní
Geny malého účinku, na tvorbě znaku se podílí více genů, nezanedbatelný je i vliv
vnějšího prostředí, většinou ovlivňuje kvantitativní znaky. Jsou rozhodující pro polygenní typ
dědičnosti
Dále se geny dělí podle jejich funkce:
a)
Strukturní
Kódují strukturu bílkoviny.
b) Regulační
Podle nich vytvořené bílkoviny regulují expresi strukturních genů, ovlivňují diferenciaci
buněk.
c) RNA geny
Dle nich se syntetizuje tRNA a rRNA.
Umístění genů a genová vazba
Geny jsou uloţeny na chromos
omech za sebou -
ve specifickém a neměnném pořadí. Kaţdý gen tak
má své unikátní místo na určitém chromosomu a na jeho určité části
-
toto místo označujeme
jako
genový lokus
.
O genech uloţených na 1 chromozomu říkáme, ţe jsou spolu v
genové vazbě
. Podle Mendelova
zákona
o nezávislé kombinovatelnosti alel se dva různé geny dědí nezávisle na sobě. To ovšem zcela
platí pouze o genech uloţených na různých chromosomech. Geny, uloţené na jednom chromosomu,
by se tedy měly dědit společně. Ani to však nemusí být pr
avda -
díky procesu zvanému
crossing-
over
. Jde o proces vzájemné rekombinace některých genů navzájem mezi párem homologních
chromosomů během meiózy. Pravděpodobnost, se kterou proběhne crossing
-over tak, aby se dva
různé geny z jednoho chromosomu přenesly nezávisle na sobě, označujeme jako
sílu genové vazby
.
Jako první se touto problematikou zabýval
Thomas Hunt Morgan
(1866 - 1945, Nobelova cena za
lékařství a fyziologii 1933). Čím je vzdálenost mezi geny na chromosomu větší, tím je větší i
pravděpodobnost rekombinace mezi nimi a síla genové vazby klesá. Naopak, pokud jsou oba
sledované geny na chromosomu velmi blízko sebe, stoupá síla genové vazby a klesá
pravděpodobnost rekombinace. Sílu vazby lze při známých výsledcích kříţení vypočíst z
rekombinačního zl
omku:
θ = počet rekombinovaných jedinců / počet všech jedinců
Jednotkou genové vzdálenosti je na Morganovu počest
1 Morgan - M
, respektive se uţívá
centimorgan - cM.
Centrální dogma
Centrální dogma představuje základní pohled na přenos realizaci genetické informace. Základní
schéma tohoto dogmatu muselo být několikrát modifikováno, my se jej předvedeme v jednodušší
formě, zachycující realizaci znaku:
DNA (Gen)
-> transkripce ->
mRNA
-> translace ->
protein
->
uplatnění proteinu
->
dědičný znak
Pokud je v ge
nu přítomná
mutace
, syntetizuje se pozměněný nebo vůbec ţádný protein, coţ má za
následek odlišný projev dědičného znaku a tím tato mutace můţe podmiňovat vznik
některých
genetických chorob
.
Dědičné znaky
Dědičné znaky jsou vlastnosti organismu vzniklé expresí genů. Jejich soubor v rámci jednoho
organismu se nazývá
fenotyp
. Některé mohou být pozorovatelné, některé jsou zjistitelné pouze za
pomoci speciálních vyšetření. Z hlediska uplatnění je dělíme na:
a) Anatomicko -
morfologické
b) Fyziologické
c) Psycho
logické
Dále je moţné znak dělit podle jejich "měřitelnosti":
a) Kvalitativní
Znaky neměřitelné, tvoří několik odlišných variant. Např. krevní skupiny v AB0 systému
(skupina A, B, AB nebo 0).
b) Kvantitativní
Znaky měřitelné, tvoří plynulou řadu variant, moţno vyjádřit Gaussovou křivkou.
Např. výška jedince (lze změřit a vyjádřit v cm).
2)
Alely
V diploidní buňce existují pro jeden
gen 2 alely
, tedy konkrétní formy genu. Alelu (případně alely),
která se vyskytuje běţně v populaci a podmiňuje normální (zdravý) fenotypový znak nazýváme alelou
divokou. Alela, jejíţ sekvence nukleotidů byla změněna
mutací
(a můţe tak podmiňovat patologický
znak), pak označujeme jako alelu mutovanou.
V případě diploidního organismu, jakým je třeba i člověk, nacházíme v buňce vţdy 2 alely příslušného
genu. Pokud jsou tyto stejné
-
je takovýto jedinec označený jako
homozygot
. Pokud jsou tyto alely
různé
-
označuje se tento jedinec jako
heterozygot
.
U heterogametického pohlaví existují učité geny uloţené na
gonozomech
, které se u daného
jedince
vyskytují pouze v jedné kopii
-
pro tyto geny se příslušný jedinec označuje jako
hemizygot
.
V klinické genetice se v souvislosti s
genetickými chorobami
pouţívá výrazu
sloţený heterozygot
,
coţ označuje stav, kdy má jedinec obě své alely
mutované
,
ovšem v kaţdé alele je tato mutace jiná.
V populaci se pro daný lokus můţe vyskytovat více neţ jedna alela. Pokud se méně častá alela
vyskytuje alespoň v 1% lokusů, potom je populace pro daný lokus
polymorfní
. Pokud je to v méně
neţ 1% lokusů
- potom jde o
vzácnou variantu.
Například pro krevní skupiny AB0 systému u člověka se v populaci běţně vyskytují alely A, B a 0.
Takovýto stav, kdy se pro daný lokus běţně v populaci vyskytuje více alel, se nazývá
mnohotná
alelie
Mezialelické vztahy mezi alelami stejné
ho genu
Úplná dominance a recesivita
-
Dominantní alela úplně potlačí projev recesivní alely. Dominantní
alela je tedy taková, která se projeví i v heterozygotní kombinaci. Ukaţme si to například na
dědičnosti
krevních skupin
u člověka: A
-
tvoří se aglutinogen A (krevní skupina A); 0
-
netvoří se
ţádný aglutinogen (krevní skupina nula); homozygot AA
-
krevní skupina A; homozygot 00
-
krevní
skupina nula; heterozygot A0 -
krevní skupina A (aglutinogen A se tvoří).
Poznámka: Je zvykem dominantní alelu označovat velkým písmenem (A) a recesivní alelu písmenem
malým (a). Divoká (wild type) alela (tedy normální varianta vyskytující se ve volné přírodě) se
označuje symbolem + (plus).
Neúplná dominance a recesivita
-
Dominantní alela nepotlačuje recesivní alelu úplně, recesivní alela
se také částečně projeví. Uvedeme si příklad na barvě květů u hypotetické květiny: A
-
červená barva;
a -
bílá barva; homozygot AA
-
červená barva; homozygot aa
-
bílá barva; heterozygot Aa
-
růţová
barva.
Kodominance
-
Obě přítomné alely se u heterozygota projeví v celé míře a navzájem se neovlivňují.
Opět uvedeme příklad s lidskými krevními skupinami. Alely A a B jsou vůči sobě kodominantní a vůči
alele 0 dominantní. Heterozygot A0
- skupina A; heterozygot B0 - skupina B; heterozygot AB - skupina
AB (tvoří se oba aglutinogeny); homozygot AA
- skupina A; homozygot BB - skupina B; homozygot 00
- skupina nula.
Superdomianance
-
Heterozygot (Aa) vykazuje silnější formu znaku neţ oba typy homozygotů (aa,
AA)
Genové interakce
V předcházejícím
textu jsme si ukázali, jakým způsobem se alely jednoho genu mohou podílet na
konečném vyjádření dědičného znaku. Existují však i interakce mezi různými páry alel (nealelické
interakce nebo interalelické interakce), které teprve určí konečnou expresi dědičného znaku. Uvedeme
si příklady na vztahu dvou alelových párů (tedy na dihybridismu, jak jej popisuje
3. Mendelův zákon
):
Komplementarita
-
Znak se projeví, pokud je přítomná alespoň jedna dominantní alela od kaţdého z
obou genů. Znak tedy najdeme u jedinců s genotypem AaBb, AABb, AaBB, AABB. Naopak u jedinců,
kde je jedna alela v homozygotně recesivní kombinaci, znak nepozorujeme
- aabb, aaBb, aaBB,
Aabb, AAbb. Rozdělení fenotypů by tudíţ nebylo klasických 9:3:3:1, ale
9:7
.
Epistáze
- Je jev, kdy jeden gen
je přímo nadřazený druhému genu a ovlivňuje tak jeho projev. Je to
vlastně taková analogie ke vztahu dominance a recesivity dvou alel jednoho genu (viz výše).
U
recesivní epistáze
recesivně homozygotní kombinace nadřazeného genu úplně potlačí případný
pro
jev genu podřazeného. Je to taková situace jako kdybyste sice měli červenou barvu na plot (projev
podřazeného genu), ale neměli ţádný plot (projev nadřazeného genu v recesivně homozygotní
kombinaci). Potom byste sice měli předpoklad pro červený plot (červenou barvu), ale protoţe ţádný
plot nemáte
-
potom se to nemůţe projevit. Přesně takto funguje tzv. Bombay fenotyp u
lidských
krevních skupin. Pokud se nesyntetizuje H antigen (genotyp hh), potom se nemůţe projevit
gen kódující krevní skupinu ABO systému (například skupinu A
-
třeba genotyp AA). Jedinec tedy
nebude mít na erytrocytech antigeny A, ačkoli má alelu pro jeho tvorbu. Očekávaný štěpný poměr
je
9:3:4
.
U
dominantní epistáze
je situace obdobná, pouze nadřazený gen potlačuje projev podřazeného
genu, p
okud je přítomna alespoň jedna jeho dominantní alela (můţe tedy být v heterozygotní i
dominantně homozygotní kombinaci). Očekávaný štěpný poměr je
12:3:1
.
3)
Zákony dědičnosti
Dědičnost je ojedinělá vlastnost ţivých organismů. Díky ní dochází k přenosu určitých znaků z
rodičovské generace na generaci potomků. Tento přenos z generace na generaci označujeme
jako
vertikální přenos
dědičné informace (shora dolů
-
jak můţeme pozorovat v
rodokmenu). Mimo to
existuje i
horizontální přenos
dědičné informace (mezi jedinci téţe generace), coţ je typické
například pro
bakterie
(více v příslušné kapitole).
Budeme-
li se zabývat dědičností znaků, je důleţité si uvědomit, jakým způsobem se příslušný druh
rozmnoţuje. Například u člověka, který se rozmnoţuje pohlavně, získává nový jedinec polovinu
genetické informace od otce a polovinu od matky. Nopak třeba u bakterií, nebo i u jiných nepohlavně
se rozmnoţujících organismů, vzniká nový jedinec z jedince původního. V případě bakterie vzniknou
dělením mateřské buňky dvě identické buňky dceřinné. V případě tasemnice, vznikají potomkové
různí, neboť tasemnice je hermafrodit, který tvoří samčí i samičí gamety (pohlavní buňky). Dědičná
informace v těchto gametách však můţe být různá (viz dále)
-
potomci tasemnice tak nejsou všichni
ide
ntičtí, jak je tomu v případě bakterie.
Bakterie a ostatní prokaryotní organismy mají ještě jednu zvláštnost. Jsou
Dostları ilə paylaş: |