321 t u e tuesday, april 23 Anatomy

M. Pirigyi and N.J. Zondlo. Univ. of Delaware.

C117 

996.8 

Isoflurane preconditioning involves the 

upregulation of aquaporin genes. 

Z. Schwamb, N. Seidler and 

C. Theisen. Kansas City Univ. of Med. and Biosci.

C118 

996.9 

The circulating molecular chaperone clusterin 

interacts with amyloidogenic transthyretin oligomers and 

modulates amyloid formation. 

M.J. Greene, E. Klimtchuk, C. 

Koch, D. Seldin and L.H. Connors. Boston Univ. Sch. of Med.

C119 

996.10  A single-molecule fluorescence system for 

studying adenylate kinase under force. 

C.A.M. Wilson, S.M. 

Leachman, B. Cervantes, A. Ierokomos, S. Marqusee and 

C. Bustamante. Univ. of California, Berkeley.

C120 

996.11  Structural and kinetic differences in 

oligomerization-fibrillation of serum amyloid A and not the 

intrinsic amyloidogenicity may contribute to pathogenesis in AA 

amyloidosis. 

S. Srinivasan, S. Patke, J.J. Aguilera, R.S. Kane 

and W. Colon. Rensselaer Polytech Inst.

C121 

996.12  Beta-arc 2 hydrogen bond network within 

hemolysin A facilitates hemolytic activation. 

E. Glasgow and T. 

Weaver. Univ. of Wisconsin-La Crosse.

C122 

996.13  Contribution of an inner core hydrogen-bonding 

network to 

b-helix stability within the two-partner secretion 

exotoxin family. 

T.M. Weaver. Univ. Wisconsin-La Crosse.

C123 

996.14  Production and characterization of oxidation-

resistant variants of the human ribonuclease inhibitor. 

A.W. 

Uebersohn and K.A. Dickson. Lawrence Univ., WI.

C124 

996.15  Analysis of the yeast de novo protein 

YNR034W-A. 

A. Shi and M. Cordes. Univ. of Arizona.

C125 

996.16  Mortal Kombat: modeling amyloid fibrils and 

health implications. 

M. Smaoui, F. Poitevin, M. Delarue, P. 

Koehl, H. Orland and J. Waldispuhl. Sch. of Computer Sci., 

McGill Univ., Inst. Pasteur, Univ. of California, Davis and CEA-

Saclay, Gif-sur-Yvette, France.

BIOCHEMISTRY TUESDAY

333

T

U

E

C126 

996.17  ER stress-independent noncanonical UPR 

activation under phenformin treatment. 

L. Yang, H. Sha, Z. Xue 

and L. Qi. Cornell Univ.

997.  MASS SPECTROSCOPY

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C127 

997.1 

A systematic study of the chemical stress 

response induced by bleach and vinegar in E. coli on viability 

and protein expression profiles using plating assays and 

matrix-assisted laser desorption ionization Biotyper™ system. 

S. Liu and D. Vardar-Ulu. Wellesley Col.

C128 

997.2 

Mass spectrometric immunoassay for insulin-

like growth factor 1. 

D. Nedelkov, E. Niederkofler, D. Phillips, 

B. Krastins, U. Kiernan, K. Tubbs and M. Lopez. Thermo 

Fisher Scientific, Tempe, AZ and Cambridge, MA.

C129 

997.3 

Muscle fiber typing by identification of the 

myosin heavy chain using LCMS. 

J. Kasper, D. Johnson, E. 

Hayes and D. King. Taylor Univ., IN.

C130 

997.4 

Development of LCMS method for monitoring 

the effects of meat feasting, fasting, and exercise on urinary 

3MH levels. 

S. Fenstermacher, K. Cleary, E. Hayes and D. 

King. Taylor Univ. , IN.

998.  CATALYTIC MECHANISMS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C131 

998.1 

Design and characterization of Thermotoga 

maritima glycerol dehydrogenase to reduce inactivation by 

dihydroxyacetone. 

P.G. Gross, J. Beauchamp and C. Vieille. 

Michigan State Univ.

C132 

998.2 

The structure, regulation and activity of non-

canonical inteins. 

K.V. Mills, J.N. Reitter, K.R. Connor, M.C. 

Nicastri, J.E. Williams, K.M. Colelli and M.D. Marieni. Col. of 

the Holy Cross.

C133 

998.3 

Rational enzyme redesign for enhancing activity 

and selectivity of heterologous taxane oxidation in engineered 

E. coli. 

V.G. Yadav, S.M. Edgar and G. Stephanopoulos. MIT.

C134 

998.4 

Towards the nitric oxide reductase mechanism 

of flavodiiron proteins. 

R. Frederick and D.M. Kurtz. Univ. of 

Texas at San Antonio.

C135 

998.5 

The structural basis of the secondary function 

of PMM1 in the presence of IMP. 

T. Ji, D. Dunaway-Mariano 

and K.N. Allen. Boston Univ. and Univ. of New Mexico.

C136 

998.6 

Experimental and computational evidence 

that ribonuclease A alters the transition state for RNA 

2’-O-transphosphorylation. 

M.E. Harris, H. Gu, K-Y. Wong, B. 

Radak, T. Dissanayake, D. Kellerman, S. Zhang, Q. Dai, M. 

Miyagi, V.E. Anderson, D. York and J. Piccirilli. Case Western 

Reserve Univ. Sch. of Med., Rutgers Univ., Piscataway and 

Univ. of Chicago.

C137 

998.7 

Kinetic mechanism of human DNA ligase I. 

P.J. 

O’Brien. Univ. of Michigan Med. Sch.

C138 

998.8 

Ligand binding and conformational change 

coupling in the HAD superfamily. 

D. Saltzberg, V. Ovchinnikov, 

D. Dunaway-Mariano, M. Karplus and K. Allen. Boston Univ., 

Harvard Univ. and Univ. of New Mexico.

999.  MOLECULAR MOTORS - FORCE AND WORK AS 

PRODUCTS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C139 

999.1 

Plasticity of the kinesin-microtubule interaction 

is encoded by the motor domain beta-sheet. 

J. Richard, E. 

Kim, E. Wojcik and S. Kim. LSU Hlth. Sci. Ctr., New Orleans.

C140 

999.2 

ATPase coupling in the processive RNA 

helicase NS3 from hepatitis C virus. 

M.J. Bradley, A. Henn, S. 

Ding, A. Pyle and E. De La Cruz. Yale Univ., Technion Israel 

Inst. of Technol., Sanford-Burnham Med. Res. Inst., La Jolla 

and HHMI, New Haven.

C141 

999.3 

Unraveling the architecture of the A1 complex 

of the Nanoarchaeum equitans A1A0 ATP synthase. 

S. 

Mohanty and C.W.V. Hogue. Natl. Univ. of Singapore.

C142 

999.4 

A search for novel substrate activity in mutants 

of L-alanine dehydrogenase. 

H. Aldeborgh and E. Mundorff. 

Vassar Col. and Hofstra Univ.

C143 

999.5 

Electron transfer without metal:. how amino 

acid radicals (mis)behave. 

W.H. Koppenol, L. Mahmoudi, R. 

Kissner and T. Nauser. ETH, Zurich.

1000. MACROMOLECULAR FOLDING AND 

FLUCTUATIONS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C144 

1000.1  Identification of the DNA binding surface on the 

SIRV capsid protein. 

H.E. Allgaier, R.E. Taurog, J.E. Johnson, 

C.E. Rohlman and B.R. Szymczyna. Albion Col., MI, The 

Scripps Res. Inst. and Western Michigan Univ.

1001. MOLECULAR MOTOR PROTEINS AND PUMPS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C145 

1001.1  Myo1c, an unconventional motor that maintains 

glomerular filtration function. 

E. Arif, L. Mallik, Y.S. Rathore, 

B. Kumari, M. Ostap, F.N.U. Ashish, L.B. Holzman and D. 

Nihalani. Univ. of Pennsylvania and CSIR-Inst. of Microbial 

Technol., India.

C146 

1001.2  Can a b/delta fusion protein replace individual 

b and delta subunits of ATP synthase in Escherichia coli? 

C.S. 

Gajadeera and J. Weber. Texas Tech Univ. and Texas Tech 

Univ. Hlth. Sci. Ctr.

TUESDAY BIOCHEMISTRY

334

C147 

1001.3  Structural model of a2-subunit N-terminus and 

its binding interface for cytohesin-2: implication for regulation of 

V-ATPase function. 

M. Merkulova, H. Hosokawa, A. Bakulina, 

P.V. Dip, Y.R. Thaker, A. Khatri, D.A. Ausiello, G. Grüber and 

V. Marshansky. Massachusetts Gen. Hosp., Harvard Med. 

Sch., State Res. Ctr. Virol. Biotech., Kolatsovo, Russia and 

Nanyang Technol. Univ., Singapore.

1002. MULTIENZYME COMPLEXES

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C148 

1002.1  C1- tetrahydrofolate synthase contribution to 

1C metabolism. 

D. Blemur , M. Field and P. Stover. Cornell 

Univ.

C149 

1002.2  NMR studies of the N-terminal domains of E2 

component of human pyruvate dehydrogenase complex. 

S. 

Kumaran, B. Birkaya, M. Patel and F. Jordan. Rutgers Univ. 

and Univ. at Buffalo SUNY.

C150 

1002.3  Investigation of protein-protein interactions in 

the pyruvate dehydrogenase complex from Escherichia coli by 

hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry. 

J. Wang, 

N.S. Nemeria and F. Jordan. Rutgers Univ., Newark.

C151 

1002.4  Develop spatially-interactive multienzyme 

complex on selfassembled DNA nanostructures. 

J. Fu. 

Biodesign at Arizona State Univ.

1003. PROTEIN INTERACTIONS IN CATALYSIS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C152 

1003.1  Thermodynamics and kinetics of the 

interactions of calmodulin with Orai. 

C-C. Wei, S. Shakya, D. 

Jensen and K. Bennett. Southern Illinois Univ. Edwardsville.

1004. REGULATION AND ALLOSTERISM

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C153 

1004.1  The allosteric regulation of phenylalanine 

hydroxylase provides a foundation for new PKU therapies. 

E.K. Jaffe, L. Stith, S.H. Lawrence, M. Andrake and R.L. 

Dunbrack. Fox Chase Cancer Ctr., Temple Hlth.

C154 

1004.2  Probing the effects of cofactor and substrate 

on conformation and flexibility of human pGDH. 

C. Roach and 

E. Bell. Univ. of Richmond.

C155 

1004.3  Regulation of assembly of bipolar myosin II 

filaments. 

A. Kandel, R. Frei and K. Prehoda. Univ. of Florida 

and Univ. of Oregon.

C156 

1004.4  Mutations found in patients Leber’s congenital 

amaurosis disrupt retinal guanylate cyclase interaction with 

rhodopsin in vitro; involvement in phototransduction. 

V.A. 

Bondarenko and K. Jones. Touro Univ. Nevada and Touro 

Univ. Nevda Col. of Osteo. Med.

C157 

1004.5  New evidence for dimerization of the short 

variant of PLA2g6, and regulation of its catalytic activity by 

Ca

2+

/calmodulin and Ca

2+

 influx factor. 

S. Korolev, P. Csutora, 

K. Peter, O. Koroleva, P. Subramanya, K. Malley and V.M. 

Bolotina. Saint Louis Univ. Sch. of Med. and Boston Univ. Sch. 

of Med.

C158 

1004.6  Structure-function studies of the ADPglucose 

pyrophosphorylase from Thermodesulfovibrio yellowstonii. 

M. 

Susoeff, E. Yik, S. Kaur, G. Dua, M. Badal, A. Orry and C.R. 

Meyer. California State Univ., Fullerton and Molsoft LLC, San 

Diego.

C159 

1004.7  Use of recombinent casein peptides as 

inhibitors of spPEP. 

S. Basak and B. Clack. Stephen F. Austin 

State Univ.

C160 

1004.8  Pyruvate revisited as a synergistic 

secondary activator of the Escherichia coli ADP-glucose 

pyrophosphorylase. 

M.A. Ballicora, M. Asención Diez and 

A.A. Iglesias. Loyola Univ. Chicago and Natl. Univ. del Litoral, 

Argentina.

C161 

1004.9  The phage e34 repressor binds to a unique 

operator. 

J.D. Williams, D. Jackson and R. Villafane. Alabama 

State Univ. and Huntingdon Col.

C162 

1004.10  The importance of a loop structure in ATP 

apparent affinity and allosteric activation of Escherichia coli 

ADP-glucose pyrophosphorylase. 

B.L. Hill, J. Wong, J. Frisby-

Zedan, B. May and M.A. Ballicora. Loyola Univ. Chicago.

C163 

1004.11  Probing the role of E304 in the allosteric 

site of ADPglucose pyrophosphorylase from Agrobacterium 

tumefaciens. 

S. Bor, H. Karzai, K. Chastain, A. Orry and C.R. 

Meyer. California State Univ., Fullerton and Molsoft LLC, San 

Diego.

C164 

1004.12  Small crosslink may stabilize P22 tail protein at 

N-terminus. 

C. Palmer, S. Johnson, D. Dean and R. Villafane. 

Alabama State Univ. and Huntingdon Col.

1005. ROLE OF DYNAMICS IN ENZYME CATALYSIS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C165 

1005.1  Structural analysis of an intein from an extreme 

thermophile. 

J.E. Williams, J.N. Reitter and K.V. Mills. Col. of 

the Holy Cross.

C166 

1005.2  The role of an extended beta-sheet in 

stabilizing the structure of a thermophilic intein. 

K.M. Colelli, 

J.M. Pusztay, J.N. Reitter and K.V. Mills. Col. of the Holy 

Cross.

BIOCHEMISTRY TUESDAY

335

T

U

E

1006. BIOPHYSICAL METHODS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C167 

1006.1  Measurement of urinary catecholamines for 

mice. 

E.A. Smith, A.L. Schwartz, T.L. Garrett and J.B. Lucot. 

Wright State Univ.

C168 

1006.2  Novel gold labeling reagent to localize protein 

in macromolecular assemblies. 

K.C. Anthony, C. You, J. 

Piehler and D. Pomeranz Krummel. Brandeis Univ. and Univ. 

of Osnabrück, Germany.

C169 

1006.3  Antibacterial activities of copper, silver and 

carbon nanoparticles in sock fabric. 

Y.G. Gete and R. Walker. 

Metropolitan State Univ. of Denver.

C170 

1006.4  FTIR microspectroscopic analysis of sodium 

butyrate induced differentiation in colon cancer cells in a time-

dependent manner. 

N. Simsek Ozek, S. Gok, S. Banerjee and 

F. Severcan. Middle East Tech Univ., Turkey.

C171 

1006.5  Neuronal networks on the nano alumina 

templates. 

A. Islam. Northeastern Univ.

1007. CYTOCHROME P450

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 12:25 

pm

-1:55 

pm

C172 

1007.1  Metoclopramide is a substrate but not an 

inactivator of CYP2D6. 

A.K. Bolles, E.D. Briggs, M.R. Livezey, 

L.D. Nagy and L.L. Furge. Kalamazoo Col.

C173 

1007.2  CYP2D6 is the major metabolizing enzyme of 

metoclopramide. 

E.D. Briggs, A.K. Bolles, M.R. Livezey and 

L.L. Furge. Kalamazoo Col.

C174 

1007.3  Interaction of mechanism-based inactivators 

with modified CYP2D6. 

M.R. Livezey, M.J. Hicks and L.L. 

Furge. Kalamazoo Col.

C175 

1007.4  Covalent modification of CYP2D6 following 

inactivation by SCH66712. 

M.J. Hicks, M.R. Livezey and L.L. 

Furge. Kalamazoo Col.

C176 

1007.5  Regio- and stereo-selective oxidation of 

fluorinated substrates by recombinant cytochrome P450 BM3 

variants. 

S.S-F. Yu, L-L. Wu, C-H. Chiang, R. Ramu, C-L. Yang, 

K.Y. Ng, W-I. Luo and S.I. Chan. Inst. of Chem., Acad. Sinica, 

Taipei, Natl. Cheng Kung Univ. and Natl. Taiwan Univ. of Sci. 

and Technol., Taiwan.

C177 

1007.6  Regulation of phase I and phase II enzyme 

gene expressions and their activities by caffeic acid, major 

compound of Perilla frutescens. 

S-Y. Yang, J-H. Kang, H-Y. 

Jung, J-E. Yang and K-W. Lee. Korea Univ.

C178 

1007.7  Metabolism of cyclophosphamide by CYP2B6 

and associated polymorphisms. 

J.M. Abbott, D. Calinski and 

P. Hollenberg. Kalamazoo Col. and Univ. of Michigan Med. 

Sch.

C179 

1007.8  Cytochrome P450 autophagy: activation by 

acute hepatic heme depletion. 

Y. Liu and M.A. Correia. UCSF.

1008. METABOLIC NETWORKS

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C180 

1008.1  Metabolic responses of the aerobic anoxygenic 

phototrophic bacterium Roseobacter denitrificans during 

photoheterotrophic and heterotrophic growth. 

J.K-H. Tang. 

Clark Univ., MA.

1009. METABOLIC REGULATION

Poster

t

ue

. 7:30 

am

—B

oston

 C

onvention

 & e

xhiBition

 C

enter

, 

e

xhiBit

 h

alls

 a-B

Presentation time: 1:05 

pm

-2:35 

pm

C181 

1009.1  Sickle hemoglobin disturbs normal coupling 

between erythrocyte O

2

 content, glycolysis and antioxidant 

capacity. 

S.C. Rogers, J. Ross, A. d’Avignon, L. Gibbons, M. 

Hassan, D. McLaughlin, S. Griffin, T. Neumayr, M. DeBaun,