Fermentlarning umumiy xususiyatlari

Substrat kuchlanishi: Yuqorida aytib o'tilganidek, ES shakllanishi paytida substratda kuchlanishni keltirib chiqarish juda muhimdir. Bu kuchlanish substratning energiya darajasini ko'tarib, uni faollashtirilgan holatga o'tkazadi. Lizozimning ta'sir mexanizmi, ko'z yoshlarida topilgan ferment β-1,4 glikozid bog'lari, ikkala substrat shtammi va kislota-ishqor katalizlarini birlashtiradi deb ishoniladi.

Kovalent kataliz: Bu yerda fermentning faol joyida manfiy zaryadlangan (nukleofil) yoki musbat zaryadlangan (elektrofil) guruh mavjud. Bu guruh substratga hujum qilib, substrat va ferment o'rtasida kovalent bog'lanishga olib keladi. Serin proteazlari, ularning faol joyida serin mavjudligi uchun nomlangan, kovalent kataliz va kislota-ishqor katalizlari bir vaqtning o'zida sodir bo'ladigan fermentlarga misol bo'ladi. Masalan, ximotripsin, tripsin va trombin.

Yaqinlik katalizi: Samarali kataliz uchun reaktivlar fermentga yaqin bo'lishi kerak. Substrat konsentratsiyasi qanchalik yuqori bo'lsa, reaktsiya tezligi shunchalik tez bo'ladi. Fermentlar o'zlarining faol joylarida substrat molekulalari bilan bog'langanligi sababli, kataliz eksponent ravishda, ko'pincha kamida ming marta ko'payishi mumkin.

Xulosa qilib aytadigan bo'lsak, ferment katalizi ko'p qirrali jarayon bo'lib, ko'pincha kislota-ishqor katalizi, substrat shtammi, kovalent kataliz va yaqinlik katalizlarining kombinatsiyasini o'z ichiga oladi. Ushbu jarayonlar birgalikda substratning faollashtirilgan holatga o'tishini osonlashtiradi va mahsulot shakllanishiga olib keladi. "Nukleofil" va "elektrofil" kabi texnik lug'atdan foydalanish bu biologik katalizatorlarning murakkab tabiatini ta'kidlaydi.

Enzimatik reaksiyalarning termodinamiği

Fermentning reaksiyaning aktivlanish energiyasiga ta'siri (A - substrat va B - mahsulot. Ferment aktivlanish energiyasini kamaytiradi)
Termodinamika fermentativ reaktsiyalarning energiya dinamikasini tushunishda hal qiluvchi rol o'ynaydi. Energiya nuqtai nazaridan fermentativ reaktsiyalarni uch xil turga bo'lish mumkin:

1.