L. A. Kadirova, A. A. No’monjonov bioinformatika o‘zbekiston Respublikasi vazirligi tomonidan ta’lim yo‘nalishi bo‘yicha darslik sifatida tavsiya etilgan

Saccharomyces cerevisiae genomi . Xamirturush eng oddiy eukaryotik organizmlardan biridir. Xamirturush hujayralari, barcha eukaryotik hujayralar singari, yadro va boshqa maxsus hujayra ichidagi bo'limlardan iborat. 1992 yilda 100 ga yaqin laboratoriyalardan iborat juda samarali xalqaro konsortsium tufayli amalga oshirilgan genomning ketma-ketligi yakunlandi. Xamirturush genomida 16 xromosomaga tarqalgan 12 057 500 ta asosiy juft yadro DNKsi mavjud. Xromosomalar ahamiyatlilik tartibidan qatʼiy nazar oʻlchamlari har xil boʻladi , toʻrtinchi xromosomaning 1352 kb/s dan birinchisining 230 kb/s gacha.
Xamirturush genomida 5885 ta oqsil kodlovchi gen, 140 ga yaqin ribosoma RNK genlari, 40 ta kichik yadroli RNK genlari va 275 ta transfer RNK genlari mavjud.
ikki sababga ko'ra murakkabroq eukariotlar Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster va odamlarning ma'lum genomlariga qaraganda kodlash hududlarida zichroqdir .
Birinchidan, intronlar nisbatan kam va nisbatan kichikdir. Faqat 231 xamirturush genida intronlar mavjud.
Ikkinchidan, takrorlanuvchi ketma-ketliklar kamroq
murakkabroq eukariotlarga nisbatan.
Taxminan 150 million yil oldin xamirturushda butun genomning takrorlanishi sodir bo'lgan deb ishoniladi. Buning ortidan takrorlangan DNK fragmentlarining translokatsiyasi va genlarning aksariyati (90% dan ortig'i) nusxalaridan birining yo'qolishi sodir bo'ldi.
Proteinlarni kodlashi mumkin bo'lgan 5885 gendan 3408 tasi ma'lum oqsillarga mos keladi. Boshqa turlardagi ma'lum oqsillarga o'xshash yana 1000 ga yaqin oqsillarni kodlaydi. Qolgan 800 ga yaqin genlar noma'lum oqsillarga mos keladigan boshqa genomlarning ochiq o'qish ramkalariga o'xshaydi. Ularning ko'pchiligi prokaryotik genlarning gomologlaridir. Xamirturush oqsillarining faqat uchdan bir qismi inson genomida aniqlanishi mumkin bo'lgan homologlarga ega.
Xamirturush oqsillarini funktsional toifalarga quyidagi tasnifi odatda qabul qilinadi:

• 
  Metabolizm.
  
• 
  Energiya.
  
• 
  Hujayra o'sishi, hujayra bo'linishi, DNK sintezi.
  
• 
  Transkripsiya.
  
• 
  Proteinlarning sintezi.
  
• 
  Protein funktsiyalari.
  
• 
  Passiv transport.
  
• 
  Hujayralarni tashish va tashish mexanizmlari.
  
• 
  Hujayra biogenezi.
  
• 
  Hujayralararo o'zaro ta'sir yoki signalizatsiya.
  
• 
  Hujayra himoyasi, hujayra o'limi va qarishi.
  
• 
  Ion gomeostazi.
  
• 
  Hujayra tashkiloti.
  
• 
  Mobil elementlar, virusli va plazmid oqsillari.
  
• 
  Tasniflanmagan.
  

Bugungi kunda xamirturush gen mahsulotlarining funktsiyalarini aniqlash usullarini sinovdan o'tkazish modelidir. Gomologlarni izlash yaxshi natijalar beradi. Har bir gen uchun nokautni o'z ichiga olgan mutantlar to'plamlari mavjud. Hujayralarni lokalizatsiya qilish va ifodalash tamoyillari kashf qilindi. Har xil turdagi o'lchovlar, shu jumladan dimerlarni shakllantirishga qodir bo'lgan oqsil juftlarining transkripsiyasini faollashtirishga asoslangan o'lchovlar asosida oqsil-oqsil o'zaro ta'sirining kataloglari yaratiladi.