L. A. Kadirova, A. A. No’monjonov bioinformatika o‘zbekiston Respublikasi vazirligi tomonidan ta’lim yo‘nalishi bo‘yicha darslik sifatida tavsiya etilgan



Yüklə 1,41 Mb.
səhifə42/95
tarix07.01.2024
ölçüsü1,41 Mb.
#211693
1   ...   38   39   40   41   42   43   44   45   ...   95
bioinfarmatika kitob o\'zbekcha0

Filogenez: TNT
Bootstrap...
O'CHIRIB
GC qiymatlari, 100 nusxa, kesilgan"l (daraxt 0) - Standard Bootstrap
sp P39610 PDXK BACSU Piridoksin
I 7 - tr_Q89ZB9_Q89ZB9_BACTN_Pyridoxi
I —I I, — sp_Q7VYK4_PDXK BORPE_Piridoksin
'—1001 ,—67— tr2Q5H184J}5H184_XANOR_Pyridoksi
II ?— sp_B2TX08 PDXK_SHIB3_Piridoksin
•—681 ,—100—sp"Q3YZC3~PDXK~SHISS Piridoksin
•—941 ,—sp_P40192_PDXK_SALTY_Piridoksin
-us- sp_Q57LS3_PDXK_SALCH_Piridoksin
O'rtacha guruhni qo'llab-quvvatlash: 88,2
1-rasm: Filogenetik daraxt (Xelsen qat'iy konsensus daraxti) filiallarni qo'llab-quvvatlash qiymatlari (%).
Kiritish:
Hizalama
chiqishlari:
Daraxt (Nelwa itnct soamshsh ) W Newick formati (agar o'chirilgan bo'lsa, MEGA tomonidan lutooutKally qayta tiklanadi)
matn chiqishi
TNT jurnallari
Eng maqbul daraxtlar topildi: 1 ta daraxt
Optimal daraxtlar (Nyuik)
» Takson nomlari assotsiatsiyasi jadvali
▼ Takson nomlari assotsiatsiyasi jadvalini yuklab oling


Shakl . 5.8. Ketma-ketliklar orasidagi filogenetik munosabatlarni qayta tiklash natijasi
(TNT dasturi).

Tanlangan misol (TNT dasturi) uchun Newick formatidagi ish natijasi quyidagicha:
(sp_P39610_PDXK_BAC SU_Piridoksin (tr_Q89ZB9_Q89ZB9_BACTN_Pyridoksi,
((tr_Q5H184_Q5H184_XANOR_Pyridoksi, sp_Q7VYK4_PDXK_BORPE_Piridoksin
e),((sp_Q57LS3_PDXK_SALCH_Pyridoxine,sp_P40192_PDXK_SALTY_Pyridoxine)
ne),(sp_Q3YZC3_PDXK_SHISS_Piridoksin,sp_B2TX08_PDXK_SHIB3_Piridoksin e)))));

  1. Ishning oxirgi bosqichi - Nyuik formatida yozilgan qavs tuzilishi yordamida filogenetik daraxtning haqiqiy yaratilishi. Buning uchun Phylogeny.fr veb-saytida taqdim etilgan tegishli dasturlarga ega blokni tanlashingiz kerak. 5.9-rasmda o'q kerakli dasturlar blokini ko'rsatadi - Tree viewers .




Yüklə 1,41 Mb.

Dostları ilə paylaş:
1   ...   38   39   40   41   42   43   44   45   ...   95




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©azkurs.org 2024
rəhbərliyinə müraciət

gir | qeydiyyatdan keç
    Ana səhifə


yükləyin