QARĞIDALI BİTKİSİNİN PLASTİD GENOMUNDAN
NÜVƏYƏ TRANSFERLƏR
Kamran YUSİFLİ, İlham ŞAHMURADOV
Bakı Dövlət Universiteti, AMEA Botanika İnstitutu
yusiflik@gmail.com, ilham@pgenomics.org
Bitki genetik sistemləri nüvə genomundan və yarımavtonom mitoxondri və plastid genomlarından ibarətdir. Hazırda
belə hesab olunur ki, simbioz yolu ilə plastidlər sianobakteriyalardan, mitoxondrilər isə protobakteriyalardan yaranmışlar və
təkamülün gedişində bu orqanellaların əcdadlarında qədim endosimbiontların genlərinin əksəriyyəti nüvəyə köçürülmüşdür;
mitoxondri və plastidlərin biogenezi və funksiyaları üçün tələb olunan zülalların əksəriyyəri sitoplazmadan "idxal" olunur.
Nəticədə plastid və mitoxondrilərin genomları dəfələrlə kiçilsə də, bu proses sona qədər getməmişdir - müəyyən genlər
indiyədək öyrənilmiş bütün orqanellərdə saxlanılmışdır. Aparılmış tədqiqatlar göstərmişdir ki, belə itirlmə/transfer
hadisələri fotosintetik eukariotların ümumi əcdadında baş vermiş, sonralar isə bitkilərinin xloroplast genləri dəstində yalnız
cüzi dəyişikliklər olmuşdur. Məsələn, güman olunur ki, Arabidopsisdə nüvə genlərinin
18%-i (4500 gen) plastid mənşəli-
dir. Müxtəlif növlərin xloroplast genomlarında ən çoxu 210 zülal kodlaşdıran gen tapılmışdır. Örtülütoxumluların analiz
olunmuş plastid genomlarının hamısında eyni 74 zülal kodlaşdıran gen və bəzi növlərdə olmayan cəmi bir neçə gen vardır.
Funksiyaları üçün tələb olunan zülallardan 10%-indən azını kodlaşdıran mitoxondrilərdə də oxşar vəziyyət müşahidə olunur.
Bu günə kimi analiz olunmuş bütün ali bitkilərin nüvə genomunda (tütün, kəsəkotu, düyü, soya, şərab üzümü və b.) hər
iki organella DNT-sinin müxtəlif uzunluqda çoxlu sayda qəlpələri tapılmışdır. Bu təqdiqat işi qarğıdalı (Zea mays)
bitkisinin nüvə genomunda plastid DNT-sinin izərinin axtarışına həsr olunmuşdur.
Aşkar olunmuşdur ki, haploid nüvə genomunun uzunluğu təxminən 2,5×10
9
nc olan qarğıdalının nüvə xromosomunun
hər birində uzunluğu 140384 nc olan xloroplast DNT-sinin (xlDNT) çoxsaylı qəlpələri mövcuddur və həmin qəlpələr,
demək olar ki, bütöv plastid genomunu (onun 99,5%-ni) təmsil edir. Lakin xlDNT-nin bu fraqmentləri xromosomlar üzrə
qeyri-bərabər paylanmışdır: xlDNT qəlpələri ilə daha zəngin olan nüvə xromosomları 1-ci (369 fraqment; xlDNT-nin
~83%-i), 2-ci (222 fraqment; ~71%) və 5-ci (232 fraqment; ~79%) xromosomlardır. XlDNT-sinin ən az təmsil olunduğu
nüvə xromosu isə 8-ci xromosomdur (131 fraqment; ~32%). Həmin çoxsaylı insersiyalardan 12-si plastid genomunun
uzunluğu 10000 nc-dən çox olan nahiyyələrini əhatə edir: 1-ci və 5-ci xromosomların hər birində 3 (müvafiq surətdə, 31297
nc, 12593 nc və 10593 nc, 31729 nc, 15185 nc və 13809 nc), 2-ci və 7-ci xromosomların hər birində 2 (müvafiq surətdə,
34513 nc və 12453 nc, 11733 nc və 10009 nc), 3-cü və 10-cu xromosomların hər birində 1 (14577 nc və25385 nc) belə uzun
insersiya aşkar edilmişdir. xlDNT-nin 34513 nc-dən ibarət olan və plastid genomunun təxminən 1/4-ni əhatə edən ən böyük
insersiyası isə 2-ci xromosomda tapılmışdır.
Bu araştırmalar nəticəsində aşkar olunan digər maraqlı fakt odur ki, xlDNT-sinin ümumi uzunluğu ~90000 nc olan 26
fraqmenti eyni zamanda mitoxondri DNT-si (mtDNT) ilə də oxşardır. Hər iki orqanellərin DNT ardıcıllıqlarının “şərikli
nüvə limanı” kimi görünən həmin rayonlar 1-ci, 2-ci, 5-ci və 10-cu nüvə xromosumlarında daha çoxdur. Bizim araşdırmalar
və ədəbiyyat məlumatları əsasında güman edirik ki, təkamülün gedişində xlDNT-si təkcə nüvə genomuna deyil, həm də
mitoxondri genomuna transfer etmişdir - yəni mitoxondri genomunda da olan həmin 26 fraqment plastid mənşəlidir.
Bundan başqa, 8 nüvə xromosomunda (4-cü və 9-cu xromosomlar istisna olmaqla) 48 xloroplast geninin intakt
nüsxələri tapılmışdır və onlardan bəzilərinin (ndhK, ndhJ, ndhC, atpB, atpE, rps2, rps18, rps15, rps19, petA, petN, petL,
rpl20, rpl23, psaI, psbZ, psbM, psbF və s) nüvədə, ən azı, transkripsiya olunmasının kDNT təsdiqi vardır. Apardığımız
əlavə araşdırmalar göstərir ki, transkripsiya olunmasının kDNT təsdiqi olan xloroplast mənşəli rps2 və ndhK nüvə
genlərinin kodlaşdıra biləcəyi polipeptidlər NH2-sonluğundakı tranzit peptidinə görə, çox güman ki, müvafiq sürətdə
mitoxondri və xloroplast təyinatlıdırlar.
Əldə olunan nəticələr və ədəbiyyat məlumatları belə güman etməyə əsas verir ki, xloroplast genlərinin nüvəyə transferi
hazırda da davam edən prosesdir.
|