Organisms as Persisters

Innovation: Speciation and Morphogenesis, edited by Lynn Margulis and René Fester, 1–14. Cam-
bridge, MA: MIT Press.
Martens, Johannes. 2010. “Organisms in Evolution.” History and Philosophy of the Life Sciences 32 (2–
3): 373–400.
Matthen, Mohan, and André Ariew. 2002. “Two Ways of Thinking About Fitness and Natural Selec-
tion.” Journal of Philosophy 99 (2): 55–83.
Moritz, Robin F. A., and Stefan Fuchs. 1998. “Organization of Honeybee Colonies: Characteristics
and Consequences of a Superorganism Concept.” Apidologie 29: 7–21.
Okasha, Samir. 2011. “Biological Ontology and Hierarchical Organization: A Defense of Rank Free-
dom.” In Major Transitions in Evolution Revisited, edited by Brett Calcott and Kim Sterelny, 53–
63. Cambridge, MA: MIT Press.
Oyama, Susan, Russell D. Gray, and Paul E. Griffiths. 2003. Cycles of Contingency: Developmental
Systems and Evolution. New York: Bradford.
Page, Paul, Zheguang Lin, Ninat Buawangpong, Huoqing Zheng, Fuliang Hu, Peter Neumann,
Panuwan Chantawannakul, and Vincent Dietemann. 2016. “Social Apoptosis in Honey Bee Su-
perorganisms.” Scientific Reports 6: 27210. https://doi.org/10.1038/srep27210.
Pechenik, Jan A. 2005. Biology of Invertebrates. New York: McGraw Hill.
Pepper, John W., and Matthew D. Herron. 2008. “Does Biology Need an Organism Concept?” Bio-
logical Reviews 83 (4): 621–627.

open access - ptpbio.org

---

smith: organisms as persisters
15
Pradeu, Thomas. 2010. “What is an Organism? an Immunological Answer.” History and Philosophical
of the Life Sciences 32 (2–3): 247–267.
Purcell, Jennifer E. 1984. “Predation on Fish Larvae by Physalia physalis, the Portuguese Man of War.”
Marine Ecology Progress Series 19:189–191.
Queller, David. C., and Joan E. Strassmann. 2009. “Beyond Society: the Evolution of Organismality.”
Philosophical Transactions of the Royal Society B, Biological Sciences. 364: 3143–3155.
Sterelny, Kim, and Paul Griffiths. 1999. Sex and Death: An Introduction to Philosophy of Biology.
Chicago: University of Chicago Press.
Torres, José-Leonel, and Lynn Trainor. 2008. “On Organism: Environment Buffers and Their Ecolog-
ical Significance.” Biology and Philosophy 23 (3): 403–416.
Theis, Kevin R., Nolwenn M. Dheilly, Jonathan L. Klassen, Robert M. Brucker, John F. Baines,
Thomas C. G. Bosch, John F. Cryan, Scott F. Gilbert, Charles J. Goodnight, Elisabeth A. Lloyd,
Jan Sapp, Philippe Vandenkoornhuyse, Ilana Zilber-Rosenberg, Eugene Rosenberg, and Seth R.
Bordenstein. 2016. “Getting the Hologenome Concept Right: An Eco-Evolutionary Framework
for Hosts and Their Microbiomes.” mSystems 1 (2):e00028–16.
Turner, J. Scott. 2002. The Extended Organism: The Physiology of Animal-Built Structures. Cambridge,
MA: Harvard University Press.
Santelices, Bernabé. 1999. “How Many Kinds of Individual are There?” Trends in Ecology and Evolu-
tion 14 (4): 152–155.
Seeley, Thomas D. 1985. Honeybee Ecology: A Study of Adaptation in Social Life. Princeton: Princeton
University Press.
Stabentheiner, Anton, Helmut Kovac, and Robert Brodschneider. 2010. “Honeybee Colony
Thermoregulation—Regulatory Mechanisms and Contribution of Individuals in Dependence
on Age, Location and Thermal Stress.” PLOS ONE 5 (1): e8967. https://doi.org/10.1371/journal.
pone.0008967.
Stearns, Stephen C. 1983. “The Evolution of Life-history Traits in Mosquitofish Since Their Intro-
duction to Hawaii in 1905: Rates of Evolution, Heritabilities, and Developmental Plasticity.”
American Zoologist 23 (1): 65–75.
Sultan, Sonia. E. 1992. “Phenotypic Plasticity and the Neo-Darwinian Legacy.” Evolutionary Trends
in Plants 6 (2): 61–71.
Walsh, Denis M. 2012. “Situated Adaptationism.” In The Environment: Philosophy, Science, and Ethics,
edited by Willian P. Kabasenche, Michael O’Rourke, and Matthew H. Slater, 89–116. Cam-
bridge, MA: MIT Press.
Walsh, Denis M. 2014. “The Affordance Landscape: the Spatial Metaphors of Evolution.” In Entan-
gled Life: Organism and Environment in the Biological and Social Sciences, edited by Gillian Barker,
Eric Desjardins, and Trevor Pearce, 213–236. New York: Springer.
Weeks, Paul. 2000. “Red-billed Oxpeckers: Vampires or Tickbirds?” Behavioral Ecology 11 (2): 154–
160.
Tautz, Jürgen. 2008. The Buzz about Bees: Biology of a Superorganism. New York: Springer.
West-Eberhard, Mary Jane. 1989. “Phenotypic Plasticity and the Origins of Diversity.” Annual Re-
view of Ecology and Systematics 20: 249–278.
West-Eberhard, Mary Jane. 2003. Developmental Plasticity and Evolution. New York, NY: Oxford
University Press.
West-Eberhard, Mary Jane. 2005. “Developmental Plasticity and the Origin of Species Differences.”
Proceedings of the National Academy of Sciences 102 (1): 6543–6549.

open access - ptpbio.org

---

smith: organisms as persisters
16
Westneat, David E., and Charles W. Fox. 2010. Evolutionary Behavioral Ecology. New York, NY: Ox-
ford University Press.
Wilson, David Sloan, and Elliott Sober. 1989. “Reviving the Superorganism.” Journal of Theoretical
Biology 136 (3): 337–356.
Wilson, Edward O. 1975. Sociobiology: The New Synthesis. Cambridge, MA: Harvard University Press.
Wilson, Jack A. 1999. Biological Individuality: The Identity and Persistence of Living Entities. Cam-
bridge: Cambridge University Press.
Wilson, Jack A. 2000. “Ontological Butchery: Organism Concepts and Biological Generalizations.”
Philosophy of Science 67: S301–S311.
© 2017 Author(s)
This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-
NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International license, which permits anyone to download, copy, dis-
tribute, or display the full text without asking for permission, provided that the creator(s) are given full
credit, no derivative works are created, and the work is not used for commercial purposes.
ISSN 2475-3025

open access - ptpbio.org

---

Document Outline

• Introduction
• Some Views about Organisms
• Kinds of Organisms
• Theoretical Desiderata
• Persistence and Its Contexts
• Constitutive Embeddedness
• Two Cluster Cases
• Holobionts and Their Implications