Fermentlarning umumiy xususiyatlari

Ferment-substrat o'zaro ta'siri

Ferment-substrat (ES) kompleksining hosil bo'lish mexanizmi (A) Qulf va kalit modeli (B) Induksiyalangan moslashish nazariyasi (C) Substrat deformatsiyasi nazariyasi.
Ferment-substrat o'zaro ta'siri biokimyo sohasida hal qiluvchi rol o'ynaydi, bu erda fermentlar, yirik oqsilli birikmalar tirik organizmlar ichidagi muhim reaktsiyalarni osonlashtirish uchun biokatalizatorlar rolini o'ynaydi. Bu reaktsiyalar turli xil hayotiy jarayonlarning ajralmas qismidir va fermentlar substratlarga ularning transformatsiyasini boshqarishda yordam beradi. Fermentlar va substratlar o'rtasidagi bu murakkab raqsni tushunish uchun ularning o'zaro ta'sirining molekulyar tafsilotlarini o'rganish kerak.
Fermentlar tashqi yuzalarida -SH va -COOH kabi funktsional guruhlar kabi o'ziga xos xususiyatlar bilan jihozlangan. Bu xususiyatlar substratlar uchun bog'lash joylari sifatida ishlaydigan ichi bo'sh joylarni yaratadi. Kontseptsiya qulfga o'rnatilgan kalitga o'xshaydi, chunki fermentning faol joyidagi zaryadlarga qarama-qarshi bo'lgan substratlar bu bo'shliqlar ichida o'z o'rnini topadi. Ushbu o'ziga xos substrat bog'lanish joyi fermentning faol joyi (E) deb ataladi.
Ferment-substrat o'zaro ta'sirini tushuntiruvchi qulay modellardan biri induktsiyalangan mos model deb nomlanadi. Ushbu modelga ko'ra, substrat va ferment o'rtasidagi o'zaro ta'sir kuchsizdan boshlanadi. Ushbu dastlabki zaif o'zaro ta'sirlar substratda ham, fermentda ham tez konformatsion o'zgarishlarni boshlaydi va ularning bog'lanishini kuchaytiradi. Bu jarayon, shuningdek, katalitik joylarni substratning bog'lanishlariga yaqinlashtiradi va keyingi kimyoviy reaktsiyalarni osonlashtiradi.
Ferment-substrat o'zaro ta'sirida kataliz jarayonining bir necha mexanizmlari yotadi:

1. 
   Bog'lanish shtammi bo'yicha kataliz: Bu mexanizm induktsiyalangan strukturaviy o'zgarishlarni o'z ichiga oladi, bu esa substrat bog'larini zo'riqtiradi va ularning o'tish holatiga erishishni osonlashtiradi. Yangi konformatsiya substrat atomlari va katalitik guruhlarni, masalan, aspartatni substrat bog'lanishlarini kuchaytiruvchi konfiguratsiyalarga majbur qiladi.
   
2.