Bioinformatika fanining rivojlanish tarixi

Oqsil ketma-ketliklari bazalari (TrEMBL).
d. TrEMBL (tarjima qilingan EMBL uchun) - bu SWISS-PROTga qo‘shimcha sifatida chiqarilgan dasturga kiritilgan oqsillar ketma-ketligi ma‘lumotlar bazasi hisoblanadi. Unda EMBL nukleotid ma‘lumotlar bazasida to‘liq tahrirlanmagan kodlash ketma-ketliklarining tarjimasi mavjud. Shunday qilib, ushbu ma‘lumot bazasida hech qachon tahrirlanmagan va organizmda aniqlanmagan oqsillar ketma- ketligini o‘z ichiga olishi mumkin.e. Protein ma’lumotlar banki (PDB): PDB-oqsil tuzilishi to‘g‘risidagi asosiy ma‘lumotlar bazasi hisoblanadi. Ma‘lumot bazasida yuqori molekulyar oqsillar biologik molekulalarning uch o‘lchamli tuzilishi to‘g‘risida kristallografik ma‘lumotlar bazasi. PDB nafaqat oqsillarning, balki nuklein kislotalar bo‘laklari, RNK molekulalari, antibiotik gramitsidin kabi yirik peptidlar, oqsil va nuklein kislotalar komplekslarining uch o‘lchamli tuzilishini ham arxivlaydi. Ma‘lumotlar bazasida asosan uchta manbadan olingan ma‘lumotlar mavjud: rentgen kristallografiyasi, tadqiqotchilar tajribalari va molekulyar modellashtirish
Oqsil strukturalari bazalari.
Protein ma’lumotlar ikkilamchi bazalari: ularda birlamchi ma‘lumotlar bazalarida joylashgan ketma-ketlikni chuqur tahlil qilish natijalarini ham o‘z ichiga oladi. Ko‘pgina oqsillarning ikkinchi darajali ma‘lumotlar bazalari turli xil oqsillarga tegishli xususiyatlarni izlash natijasidir. Ba‘zi bir ishlatiladigan ketma- ketlik va tuzilishning ikkinchi darajali ma‘lumotlar bazalari quyidagilar kiradi:a. MHCPep:MHCPep - bu 13000 dan ortiq peptid ketma-ketligidan tashkil topgan ma‘lumotlar bazasi, bu immunitet tizimining asosiy gistomansublik kompleksi to‘g‘risidagi ma‘lumotlarni saqlaydi.b. PROSIT: Bu birinchi ishlab chiqilgan ikkinchi ma‘lumotlar bazasi. Undan foydalanib, yangi ketma-ketlik qidirilganda oqsillar oilasini osongina topishimiz mumkin. Shunday qilib, PROSIT tarkibida proteinlar domenlari, oilalar va funktsional joylarni tavsiflovchi hujjatlar yozuvlari, shuningdek ularni aniqlash uchun bog‘langan monomer va profillar mavjud.c.Profillar. Profil ma‘lumotlar bazasi ketma-ketlikni moslashtirishda muhim saqlanib qolgan hududlarni aniqlash uchun ishlatiladi.